More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0002 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  98.68 
 
 
379 aa  756  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  95.28 
 
 
381 aa  734  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  98.94 
 
 
379 aa  759  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  96.59 
 
 
381 aa  744  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.41772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  98.94 
 
 
379 aa  759  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  96.59 
 
 
381 aa  744  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  99.47 
 
 
379 aa  763  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  99.74 
 
 
379 aa  766  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  8.20509e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  98.68 
 
 
379 aa  756  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  95.28 
 
 
381 aa  737  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 
379 aa  768  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  74.14 
 
 
378 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.67002e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  71.77 
 
 
378 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  53.56 
 
 
377 aa  416  1e-115  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.03 
 
 
377 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.03 
 
 
377 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.46 
 
 
380 aa  344  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  44.88 
 
 
376 aa  322  9e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.88302e-11  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  42.15 
 
 
378 aa  307  2e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  40.53 
 
 
376 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  8.41235e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  40.26 
 
 
376 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  40.26 
 
 
376 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  40 
 
 
376 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  40 
 
 
376 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  40.26 
 
 
376 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0623e-09 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  40 
 
 
376 aa  295  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.10658e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  39.21 
 
 
376 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  4.91978e-05 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  39.47 
 
 
376 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  42.44 
 
 
374 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  38.95 
 
 
376 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.95 
 
 
378 aa  267  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.96 
 
 
380 aa  263  4e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  38.32 
 
 
378 aa  263  6e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.99 
 
 
366 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.99 
 
 
366 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.75 
 
 
374 aa  259  5e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  3.74529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.98 
 
 
365 aa  254  1e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.09 
 
 
367 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.53 
 
 
370 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.25 
 
 
370 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  7.29086e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.62 
 
 
367 aa  235  1e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.36 
 
 
366 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  35.71 
 
 
366 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.01 
 
 
370 aa  214  1e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.15 
 
 
374 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  1.16577e-06 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.36 
 
 
389 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  32.45 
 
 
366 aa  201  2e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.1 
 
 
372 aa  200  4e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.59068e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  29.87 
 
 
376 aa  196  8e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.87 
 
 
367 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  30.41 
 
 
374 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30 
 
 
366 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  5.53224e-06  hitchhiker  3.89013e-07 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  30.83 
 
 
370 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.83 
 
 
372 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  29.06 
 
 
372 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  31.51 
 
 
372 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  3.50231e-06 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  31.25 
 
 
372 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  29.97 
 
 
378 aa  186  8e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  5.12645e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  30.23 
 
 
378 aa  185  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.28167e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  31.25 
 
 
372 aa  185  1e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.01 
 
 
372 aa  185  1e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.74 
 
 
365 aa  185  1e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  29.72 
 
 
378 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.28779e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  33.07 
 
 
367 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  30.29 
 
 
372 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.01 
 
 
372 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.38199e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.75 
 
 
372 aa  182  9e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  30.91 
 
 
372 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  29.77 
 
 
372 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.46 
 
 
373 aa  180  3e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  29.9 
 
 
372 aa  180  3e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.61 
 
 
376 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.91 
 
 
372 aa  179  6e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  2.75643e-08  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  30.65 
 
 
372 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.98 
 
 
372 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.51 
 
 
369 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52181e-08 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.99 
 
 
397 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.53 
 
 
372 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  30.73 
 
 
397 aa  177  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  27.53 
 
 
377 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.95 
 
 
385 aa  175  1e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.98 
 
 
390 aa  175  1e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  31.28 
 
 
373 aa  175  1e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  29.35 
 
 
372 aa  174  2e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.79 
 
 
375 aa  174  2e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.79 
 
 
375 aa  174  2e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.39 
 
 
373 aa  174  3e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.53 
 
 
375 aa  173  4e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  28.83 
 
 
412 aa  172  8e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.9 
 
 
373 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 
386 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  29.64 
 
 
378 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.46 
 
 
372 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.2 
 
 
373 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  28.83 
 
 
373 aa  170  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.9 
 
 
373 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.6 
 
 
372 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.87 
 
 
373 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  9.29484e-07 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.51 
 
 
369 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  30.79 
 
 
386 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>