76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0821 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  53.9 
 
 		 286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  55.51 
 
 		 276 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  54.41 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  51.94 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  47.97 
 
 		 312 aa  271  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  53.05 
 
 		 302 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  49.17 
 
 		 306 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  52.33 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  55.98 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  25.48 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  32.45 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  28.12 
 
 		 387 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  28.94 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 1019 aa  82  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  29.96 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  28.47 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  30.51 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  23.72 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  30.51 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  30.51 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  22.71 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  27.41 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  23.2 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  28.04 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  29.43 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  27.57 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  27.34 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  28.9 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  26.94 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  27.78 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  25.37 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  26.71 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  27.34 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  28.95 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  26.67 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  22.22 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  24.63 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  28.19 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  29.92 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  27.88 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  28.3 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  29.85 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  25.99 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  28.85 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  28.85 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  28.02 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  26.32 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  26.25 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  31.62 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  26.64 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  21.01 
 
 		 781 aa  62.8  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  21.24 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  29.48 
 
 		 1052 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  25.09 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  26.52 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  26.67 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  24.02 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  31.07 
 
 		 1055 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 946 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 946 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  25.28 
 
 		 1051 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  25.56 
 
 		 1051 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  25.56 
 
 		 1051 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  27.17 
 
 		 1038 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 1038 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  23.77 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 1062 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  26.52 
 
 		 1016 aa  45.8  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  31.72 
 
 		 864 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  29.76 
 
 		 1095 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.74 
 
 		 836 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 1048 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.46 
 
 		 1058 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  21.79 
 
 		 780 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.95 
 
 		 1083 aa  42.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>