188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0270 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  100 
 
 
1126 aa  2291    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  56.61 
 
 
1109 aa  1240    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  88.3 
 
 
1122 aa  2015    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  88.72 
 
 
1120 aa  2020    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 
1054 aa  416  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 
991 aa  216  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
1007 aa  170  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  25.95 
 
 
972 aa  145  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 
1066 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 
1188 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  24.25 
 
 
1007 aa  134  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
1066 aa  132  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 
888 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
993 aa  129  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 
1105 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  23.32 
 
 
485 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  31.23 
 
 
1075 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  25.94 
 
 
997 aa  112  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  30.06 
 
 
1203 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  28.53 
 
 
1195 aa  112  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  26.05 
 
 
994 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  30.18 
 
 
1141 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 
1007 aa  108  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 
1176 aa  108  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  30.77 
 
 
1069 aa  106  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 
1100 aa  106  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 
1041 aa  105  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  28.98 
 
 
1052 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 
897 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  29.18 
 
 
1037 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  29.41 
 
 
1196 aa  102  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
1149 aa  102  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 
1206 aa  102  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 
935 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  25.19 
 
 
1001 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  29 
 
 
1298 aa  99.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  26.24 
 
 
1161 aa  99.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  27.55 
 
 
1194 aa  99.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.53 
 
 
1125 aa  98.6  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
1123 aa  98.6  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  28.4 
 
 
1162 aa  98.2  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  29.69 
 
 
1074 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 
1087 aa  97.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 
1167 aa  96.3  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  25.63 
 
 
986 aa  94.7  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  26.85 
 
 
1210 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 
1232 aa  94  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  26.3 
 
 
511 aa  94.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 
1114 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  25.82 
 
 
1068 aa  94.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 
1105 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 
966 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  26.15 
 
 
1053 aa  92.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  27.35 
 
 
979 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  26.4 
 
 
1075 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
1153 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 
952 aa  90.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  30 
 
 
1089 aa  89.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  28.71 
 
 
1071 aa  88.6  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  24.57 
 
 
1071 aa  87.8  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  26.44 
 
 
1081 aa  88.2  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  23.04 
 
 
1074 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
1124 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.13 
 
 
1050 aa  86.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  25.14 
 
 
1125 aa  85.5  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  26.18 
 
 
1067 aa  84.7  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  27.71 
 
 
1257 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  28.09 
 
 
1056 aa  84.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
1065 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
1123 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  27.12 
 
 
1132 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  26.4 
 
 
1057 aa  82.8  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  24.19 
 
 
1068 aa  82  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  26.52 
 
 
1077 aa  82  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 
1010 aa  82  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  25.91 
 
 
1008 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  23.92 
 
 
1105 aa  79  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  27.25 
 
 
1008 aa  79  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  25.71 
 
 
1051 aa  78.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 
1097 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  25.32 
 
 
1061 aa  78.6  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  24.06 
 
 
1041 aa  78.2  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  27.06 
 
 
1066 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
1008 aa  77.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.21 
 
 
992 aa  77.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.71 
 
 
1066 aa  75.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  28.46 
 
 
791 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  27.46 
 
 
1116 aa  71.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  25.08 
 
 
1173 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  26.06 
 
 
1010 aa  69.7  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 
771 aa  69.7  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 
775 aa  68.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  27.71 
 
 
1122 aa  68.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  24.84 
 
 
1129 aa  68.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 
814 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.47 
 
 
1008 aa  66.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  25.15 
 
 
1162 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 
797 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 
753 aa  63.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 
1016 aa  62  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>