More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1066 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  50.44 
 
 
237 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  45.37 
 
 
235 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  45.89 
 
 
237 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  44.59 
 
 
234 aa  196  4e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  44.16 
 
 
235 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  42.26 
 
 
258 aa  164  1e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  39.66 
 
 
242 aa  153  3e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  39.22 
 
 
260 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  39.22 
 
 
260 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  39.22 
 
 
260 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  38.36 
 
 
260 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  39.22 
 
 
260 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  37.55 
 
 
260 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  37.55 
 
 
260 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  37.55 
 
 
260 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  37.55 
 
 
263 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  37.55 
 
 
260 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  37.55 
 
 
263 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  37.55 
 
 
260 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  37.55 
 
 
263 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  37.55 
 
 
263 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  38.57 
 
 
233 aa  141  1e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  35.68 
 
 
234 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  33.62 
 
 
261 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  35.53 
 
 
249 aa  114  1e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
248 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.01 
 
 
227 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.56 
 
 
255 aa  98.6  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  32 
 
 
245 aa  98.6  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  2.18359e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  31.56 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  33.19 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  9.10713e-05  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  34.65 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  35.4 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3432  GntR domain protein  34.06 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  34.51 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  34.51 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  34.51 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.51 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
258 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  33.76 
 
 
273 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  9.57079e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  26.27 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.10321e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29 
 
 
238 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  31.84 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  31.47 
 
 
240 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  31.43 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  3.78938e-05 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.3 
 
 
233 aa  92.4  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 
253 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
252 aa  92.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
253 aa  92  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
251 aa  92  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  1.69252e-07 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  31.17 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
318 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  31.74 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4324  GntR domain-containing protein  31.37 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  35.24 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  28.57 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  28.33 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  31.98 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.68 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
237 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  32.14 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  32.74 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
268 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.91 
 
 
241 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  32.68 
 
 
231 aa  88.6  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  27.16 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  36.48 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  31.7 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  35.19 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.02 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4358  regulatory protein GntR, HTH  31.11 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.06 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  29.09 
 
 
379 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.51 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.85286e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
228 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4009  regulatory protein GntR, HTH  31.11 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  34.26 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  28.77 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
221 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  33.2 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
257 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  30.96 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
366 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  26.12 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>