More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2329 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.66 
 
 
891 aa  772    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  45.9 
 
 
1942 aa  842    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  52.91 
 
 
1117 aa  1047    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  100 
 
 
991 aa  2037    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.83 
 
 
1855 aa  704    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  40.18 
 
 
1062 aa  725    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  49.72 
 
 
1176 aa  828    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  45.4 
 
 
1891 aa  688    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.93 
 
 
1035 aa  707    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  48.39 
 
 
1025 aa  792    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.13 
 
 
946 aa  775    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.46 
 
 
1248 aa  644    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.49 
 
 
2068 aa  686    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.88 
 
 
1975 aa  732    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  48.12 
 
 
1331 aa  776    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  36.5 
 
 
1328 aa  609  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.91 
 
 
2156 aa  599  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  37.26 
 
 
1441 aa  602  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.75 
 
 
1124 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  35.69 
 
 
1329 aa  594  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.94 
 
 
1440 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.94 
 
 
1440 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  35.93 
 
 
1432 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  37.11 
 
 
998 aa  524  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  33.72 
 
 
1429 aa  515  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  34.26 
 
 
1450 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  33.43 
 
 
1472 aa  506  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  38.58 
 
 
717 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  28.8 
 
 
874 aa  331  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  26.58 
 
 
850 aa  325  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  26.48 
 
 
852 aa  321  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  26.38 
 
 
852 aa  320  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  26.48 
 
 
852 aa  320  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  26.48 
 
 
852 aa  320  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  26.62 
 
 
848 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  28.63 
 
 
2638 aa  308  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  28.77 
 
 
1043 aa  307  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  26.05 
 
 
848 aa  303  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  26.23 
 
 
852 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  31.27 
 
 
1136 aa  295  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  25.74 
 
 
856 aa  294  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  27.23 
 
 
843 aa  293  9e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  25.83 
 
 
852 aa  293  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  28.18 
 
 
655 aa  288  5e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  27.02 
 
 
841 aa  286  9e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  30.18 
 
 
647 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  28.59 
 
 
655 aa  284  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.3 
 
 
1888 aa  281  6e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  26.36 
 
 
843 aa  280  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  28.63 
 
 
640 aa  277  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  25.53 
 
 
899 aa  273  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  24.82 
 
 
842 aa  267  7e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  29.15 
 
 
825 aa  261  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  30.77 
 
 
718 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  29.62 
 
 
928 aa  244  5e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  26.66 
 
 
713 aa  234  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  26.66 
 
 
713 aa  234  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  26.19 
 
 
1064 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  25.7 
 
 
713 aa  233  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  25.83 
 
 
1064 aa  233  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  25.7 
 
 
713 aa  233  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  26.66 
 
 
713 aa  231  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  26.24 
 
 
713 aa  231  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  26.8 
 
 
713 aa  231  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  30.03 
 
 
601 aa  229  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  29.05 
 
 
712 aa  229  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  28.25 
 
 
713 aa  226  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  28.27 
 
 
669 aa  226  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  27.45 
 
 
713 aa  218  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  27.11 
 
 
713 aa  217  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  27.73 
 
 
766 aa  190  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  26.49 
 
 
640 aa  177  8e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  24.81 
 
 
1252 aa  159  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  24.47 
 
 
776 aa  146  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  25.8 
 
 
721 aa  134  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  26.67 
 
 
719 aa  125  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1637  glycogen debranching enzyme GlgX  25.7 
 
 
691 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  24.6 
 
 
711 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  26.51 
 
 
722 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  24.6 
 
 
711 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  24.29 
 
 
727 aa  119  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  23.4 
 
 
817 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  24.96 
 
 
717 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  27.14 
 
 
711 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  24.34 
 
 
712 aa  117  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  24.47 
 
 
701 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  23.09 
 
 
710 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  26.79 
 
 
702 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  25.05 
 
 
711 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  25.7 
 
 
729 aa  115  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  24.34 
 
 
683 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  25.34 
 
 
701 aa  115  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  25.57 
 
 
712 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  25.11 
 
 
709 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  24.72 
 
 
845 aa  112  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  26.46 
 
 
703 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  25.57 
 
 
712 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  23.54 
 
 
701 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  23.04 
 
 
677 aa  111  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1306  glycogen debranching enzyme GlgX  25.24 
 
 
720 aa  111  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.348446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>