83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0524 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  40.8 
 
 
452 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  27.61 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  25.15 
 
 
457 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  29.33 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  37.93 
 
 
619 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  29.66 
 
 
532 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  32.91 
 
 
443 aa  55.8  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  32.19 
 
 
452 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  30.28 
 
 
427 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  33.03 
 
 
451 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  30.95 
 
 
446 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  28.78 
 
 
461 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  36.71 
 
 
368 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  25.69 
 
 
630 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  40 
 
 
976 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  32.32 
 
 
445 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.95 
 
 
429 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  21.85 
 
 
418 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  20.56 
 
 
588 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  34.44 
 
 
369 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  31.47 
 
 
540 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  29.76 
 
 
450 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  41.18 
 
 
437 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  35.71 
 
 
448 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  29.03 
 
 
423 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  40 
 
 
513 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  24.17 
 
 
556 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  34.29 
 
 
457 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  31.73 
 
 
695 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  31.33 
 
 
444 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  33.8 
 
 
455 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  38.24 
 
 
556 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  26.89 
 
 
506 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  30.53 
 
 
606 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  27.84 
 
 
464 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  26.75 
 
 
430 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  37.8 
 
 
562 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  31.01 
 
 
453 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  29.93 
 
 
516 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  36.51 
 
 
712 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  28.99 
 
 
442 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  29.27 
 
 
448 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  34.72 
 
 
440 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  29.27 
 
 
448 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  24.85 
 
 
447 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  27.17 
 
 
439 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  29.73 
 
 
412 aa  45.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  24.86 
 
 
601 aa  45.4  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  31.87 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  32.56 
 
 
416 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  34.55 
 
 
486 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  27.97 
 
 
427 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  25.45 
 
 
582 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  23.91 
 
 
530 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  24 
 
 
478 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  27.35 
 
 
509 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  32.79 
 
 
453 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  24.82 
 
 
422 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  27.94 
 
 
423 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  36.23 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  26.89 
 
 
482 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  30.23 
 
 
460 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  27.21 
 
 
422 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  25 
 
 
452 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  31.48 
 
 
323 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  30.53 
 
 
408 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 
652 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  25.37 
 
 
476 aa  42.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  31.18 
 
 
505 aa  42.7  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  31.96 
 
 
736 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  33.67 
 
 
460 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  25.71 
 
 
533 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  33.67 
 
 
460 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  25.62 
 
 
410 aa  42.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  22.12 
 
 
410 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  36 
 
 
571 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  33.78 
 
 
486 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  28 
 
 
440 aa  42.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  44.68 
 
 
607 aa  42  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  40.74 
 
 
406 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  34.78 
 
 
643 aa  42  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.75 
 
 
640 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>