More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1858 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
476 aa  938    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.14 
 
 
484 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.08 
 
 
465 aa  229  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 
460 aa  226  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2289  major facilitator transporter  40.14 
 
 
485 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00392793  hitchhiker  0.000728467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.06 
 
 
500 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.22 
 
 
477 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.61 
 
 
477 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 
475 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 
482 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.16 
 
 
456 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 
474 aa  200  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 
477 aa  199  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.63 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 
493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.44 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.54 
 
 
483 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.82 
 
 
486 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.76 
 
 
478 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.19 
 
 
474 aa  190  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.7 
 
 
483 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.53 
 
 
493 aa  189  9e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  30.36 
 
 
492 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.53 
 
 
501 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 
496 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0670  major facilitator transporter  36.12 
 
 
484 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12328  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  32.78 
 
 
476 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 
528 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.08 
 
 
462 aa  183  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 
495 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  30.97 
 
 
470 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 
482 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  32.08 
 
 
503 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 
475 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  30.68 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  31.47 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  32.82 
 
 
466 aa  180  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 
541 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  31.14 
 
 
478 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 
478 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 
478 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 
487 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  34.15 
 
 
510 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  31.24 
 
 
466 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
573 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.31 
 
 
478 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  31.16 
 
 
478 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 
472 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 
476 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  29.07 
 
 
484 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 
478 aa  177  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.9 
 
 
469 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  27.78 
 
 
458 aa  176  6e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  32.12 
 
 
465 aa  176  8e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 
482 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  32.83 
 
 
477 aa  176  8e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  30.89 
 
 
478 aa  176  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  30.38 
 
 
467 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.9 
 
 
466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.38 
 
 
607 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 
480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.56 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.63 
 
 
479 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  31.87 
 
 
465 aa  172  9e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 
478 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
496 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.62 
 
 
463 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 
495 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
608 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.93 
 
 
522 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  30.77 
 
 
457 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  30.77 
 
 
457 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  29.22 
 
 
479 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.07 
 
 
504 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
457 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  30.53 
 
 
457 aa  170  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  30.53 
 
 
457 aa  170  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  30.53 
 
 
457 aa  170  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  30.53 
 
 
457 aa  170  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.91 
 
 
482 aa  170  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  30.29 
 
 
457 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  30.53 
 
 
457 aa  169  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 
480 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
491 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  32.35 
 
 
446 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
496 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.65 
 
 
569 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
457 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 
523 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  31.7 
 
 
472 aa  167  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  29.95 
 
 
488 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1318  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.15 
 
 
467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 
539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3524  major facilitator family multidrug efflux transporter  30.23 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  29.78 
 
 
455 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  31.58 
 
 
461 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  29.78 
 
 
455 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>