More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1418 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1418  tRNA-dihydrouridine synthase A  100 
 
 		 330 aa  685    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1566  tRNA-dihydrouridine synthase A  97.27 
 
 		 330 aa  669    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0746  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.35 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3912  tRNA-dihydrouridine synthase A  49.66 
 
 		 335 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0718  tRNA-dihydrouridine synthase A  49.66 
 
 		 334 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00191335  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3243  tRNA-dihydrouridine synthase A  50.68 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.021676  hitchhiker  0.00000290889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0806  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.15 
 
 		 339 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0774  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.15 
 
 		 339 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.638276  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3585  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.47 
 
 		 339 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.238012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2790  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.28 
 
 		 327 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1669  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.95 
 
 		 360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0799  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.15 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0766  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.99 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3232  tRNA-dihydrouridine synthase A  49.66 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0761  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.25 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00024082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3341  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.49 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0536  tRNA-dihydrouridine synthase A  48.33 
 
 		 329 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00246353  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3570  tRNA-dihydrouridine synthase A  48.82 
 
 		 328 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3055  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.51 
 
 		 326 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.571193  normal  0.701186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0744  TIM-barrel protein, yjbN family  49 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4453  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.46 
 
 		 336 aa  298  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3495  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.86 
 
 		 340 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0399  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.96 
 
 		 338 aa  298  7e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3631  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.53 
 
 		 340 aa  297  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4203  tRNA-dihydrouridine synthase A  48.15 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  hitchhiker  0.0000157643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2960  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.28 
 
 		 337 aa  295  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0713  TIM-barrel protein, yjbN family  49.5 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0573844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002346  tRNA dihydrouridine synthase A  47.22 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1734  tRNA-dihydrouridine synthase A  48.81 
 
 		 348 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00617531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1302  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.49 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0353  tRNA-dihydrouridine synthase A  43.87 
 
 		 335 aa  292  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3123  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.28 
 
 		 330 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3944  TIM-barrel protein, yjbN family  46.31 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4290  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.31 
 
 		 347 aa  292  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4510  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.31 
 
 		 339 aa  292  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4601  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.31 
 
 		 347 aa  292  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03921  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.33 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03881  hypothetical protein  46.33 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4546  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.31 
 
 		 347 aa  292  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3979  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.33 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.16691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2388  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.76 
 
 		 337 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0913736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3858  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.49 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.606559  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3768  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.49 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0342363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5551  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.31 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1725  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.04 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1700  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.53 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4051  tRNA-dihydrouridine synthase A  43.13 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000175838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1852  tRNA-dihydrouridine synthase A  43.67 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0789  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.33 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.683561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4491  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.98 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0345216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1641  YjbN family TIM-barrel protein  43.49 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406023 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2066  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.26 
 
 		 343 aa  285  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0795  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.33 
 
 		 321 aa  285  5e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4500  tRNA-dihydrouridine synthase A  45.79 
 
 		 332 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0253  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.26 
 
 		 331 aa  285  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4585  tRNA-dihydrouridine synthase A  45.79 
 
 		 332 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4637  tRNA-dihydrouridine synthase A  45.79 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4586  tRNA-dihydrouridine synthase A  45.79 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.787094  normal  0.942964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1088  tRNA-dihydrouridine synthase A  45.61 
 
 		 365 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0247778  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1568  tRNA-dihydrouridine synthase A  45.61 
 
 		 365 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644726  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1050  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.26 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2485  tRNA-dihydrouridine synthase A  44.13 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0461932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1996  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.08 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00283528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3399  tRNA-dihydrouridine synthase A  48.48 
 
 		 332 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1729  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.23 
 
 		 342 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000628282 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0970  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.68 
 
 		 353 aa  281  8.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.5228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4710  tRNA-dihydrouridine synthase A  44.93 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00009  tRNA-dihydrouridine synthase A  47.62 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1043  tRNA-dihydrouridine synthase A  45.94 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.648641  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1664  tRNA-dihydrouridine synthase A  43.61 
 
 		 357 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000128148  normal  0.374359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0110  tRNA-dihydrouridine synthase A  42.77 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1943  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.42 
 
 		 331 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1544  tRNA-dihydrouridine synthase A  45.52 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000130632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0048  tRNA-dihydrouridine synthase A  45.72 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2122  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.94 
 
 		 333 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1275  TIM-barrel protein, yjbN family  43.55 
 
 		 329 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1469  tRNA-dihydrouridine synthase A  44.26 
 
 		 344 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0655175  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1755  tRNA-dihydrouridine synthase A  42.86 
 
 		 333 aa  275  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1989  tRNA-dihydrouridine synthase A  45.27 
 
 		 351 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.931204  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1843  tRNA-dihydrouridine synthase A  42.95 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03597  tRNA-dihydrouridine synthase A  42.2 
 
 		 348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.263029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1829  tRNA-dihydrouridine synthase A  42.95 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.76295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0371  tRNA-dihydrouridine synthase A  44.59 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.167917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1227  tRNA-dihydrouridine synthase A  44.59 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1996  tRNA-dihydrouridine synthase A  42.95 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.209677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0790  tRNA-dihydrouridine synthase A  44.59 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.54694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1714  tRNA-dihydrouridine synthase A  44.59 
 
 		 436 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.073679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2494  tRNA-dihydrouridine synthase A  42.32 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.38061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2043  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.74 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0148288  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3456  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.69 
 
 		 318 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62577  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2153  tRNA-dihydrouridine synthase A  46.13 
 
 		 344 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1038  TIM-barrel protein, yjbN family  42.47 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.112762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1490  tRNA-dihydrouridine synthase A  44.14 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1832  TIM-barrel protein, yjbN family  41.56 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1936  tRNA-dihydrouridine synthase A  44.56 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.564844  normal  0.370687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1916  tRNA-dihydrouridine synthase A  44.52 
 
 		 352 aa  266  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648833  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1710  tRNA-dihydrouridine synthase A  43.28 
 
 		 336 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262084  hitchhiker  0.0000258631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2017  tRNA-dihydrouridine synthase A  43.33 
 
 		 341 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0856  tRNA-dihydrouridine synthase A  44.33 
 
 		 340 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3573  tRNA-dihydrouridine synthase A  43.67 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>