More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0793 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0793  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.542741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1542  DNA repair protein RadC  89.47 
 
 		 162 aa  212  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  60.2 
 
 		 263 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  55.43 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  47.27 
 
 		 203 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  66.27 
 
 		 254 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  66.27 
 
 		 223 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  63.75 
 
 		 257 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  52 
 
 		 209 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  67.95 
 
 		 261 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  66.25 
 
 		 258 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  49.46 
 
 		 236 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  42.61 
 
 		 242 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  62.03 
 
 		 254 aa  103  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  48.7 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  52.81 
 
 		 242 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  47.31 
 
 		 239 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  53.41 
 
 		 251 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  47.31 
 
 		 239 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  53.93 
 
 		 247 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  47.31 
 
 		 250 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  49.44 
 
 		 278 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  51.61 
 
 		 260 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  52.81 
 
 		 243 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  46.24 
 
 		 254 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  50.56 
 
 		 241 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  51.06 
 
 		 273 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  53.95 
 
 		 249 aa  97.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  53.95 
 
 		 246 aa  97.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  53.95 
 
 		 249 aa  97.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  60.53 
 
 		 253 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  50.56 
 
 		 275 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  49.44 
 
 		 238 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  56.58 
 
 		 226 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  49.44 
 
 		 275 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  55.26 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  49.44 
 
 		 246 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  50.62 
 
 		 265 aa  90.1  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  49.44 
 
 		 223 aa  90.1  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 248 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 248 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  55 
 
 		 221 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  39.08 
 
 		 230 aa  85.5  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  48.54 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 245 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  48.05 
 
 		 255 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  49.37 
 
 		 248 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  39.08 
 
 		 230 aa  84.3  5e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  43.01 
 
 		 246 aa  84.3  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 230 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08165  DNA repair protein RadC  44.12 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  40.52 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  46.94 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  36.46 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  45.74 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  46.94 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  45.92 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0308  RadC family DNA repair protein  44.79 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00747747  hitchhiker  0.00434898 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1402  DNA repair protein, RadC family  40.38 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0957622 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1032  DNA repair protein RadC  43.75 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0492  DNA repair protein RadC  37.93 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4157  DNA repair protein RadC  43.75 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4896  RadC family DNA repair protein  39.42 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1125  DNA repair protein, RadC family  39.42 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1062  RadC family DNA repair protein  39.42 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2246  RadC family DNA repair protein  39.42 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4680  DNA repair protein, RadC family  39.42 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3209  RadC family DNA repair protein  39.42 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3410  RadC family DNA repair protein  39.42 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2855  DNA repair protein, RadC family  39.42 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109102 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3359  DNA repair protein RadC  41.35 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  44.21 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4804  RadC family DNA repair protein  39.42 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  44.9 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3350  RadC family DNA repair protein  39.42 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1655  DNA repair protein RadC  41.24 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153921  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  44.9 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3005  DNA repair protein RadC  44.9 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  40.82 
 
 		 242 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  43.62 
 
 		 224 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  42.27 
 
 		 224 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  40.82 
 
 		 224 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  36.21 
 
 		 236 aa  73.6  0.0000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  41.24 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1658  hypothetical protein  40.82 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00985169  normal  0.385856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1867  DNA repair protein RadC  40.82 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2620  hypothetical protein  37.74 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  41.24 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  0.000000662884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  41.75 
 
 		 224 aa  72  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  41.75 
 
 		 224 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2319  DNA repair protein RadC  40.82 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5335  DNA repair protein RadC  44.9 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  41.24 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  43.88 
 
 		 238 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  45.36 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31260  RadC-like protein  40.82 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145795  unclonable  2.34568e-22 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  42.72 
 
 		 224 aa  70.5  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>