More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3544 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3544  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  448  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  74.21 
 
 
431 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2874  major facilitator transporter  64.24 
 
 
435 aa  211  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.992422  normal  0.445926 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7147  major facilitator superfamily MFS_1  74.1 
 
 
430 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5999  major facilitator superfamily MFS_1  74.55 
 
 
430 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202458  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4867  major facilitator transporter  67.31 
 
 
445 aa  188  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  normal  0.357846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1855  major facilitator superfamily MFS_1  65.64 
 
 
441 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1472  major facilitator transporter  58.08 
 
 
448 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2075  major facilitator transporter  57.42 
 
 
435 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5387  major facilitator transporter  48.48 
 
 
441 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.330273  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  41.88 
 
 
449 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  42.07 
 
 
458 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  42.04 
 
 
437 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  42.07 
 
 
452 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  41.46 
 
 
452 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3929  major facilitator transporter  46 
 
 
436 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3591  major facilitator transporter  46 
 
 
436 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163155  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  42.02 
 
 
437 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3497  major facilitator transporter  45.33 
 
 
436 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.61978  hitchhiker  0.00838162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5327  major facilitator transporter  45.33 
 
 
436 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7147  major facilitator superfamily MFS_1  47.97 
 
 
435 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.604995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.72 
 
 
437 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.38 
 
 
440 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
441 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
441 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  35.37 
 
 
432 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  46.54 
 
 
436 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3079  major facilitator transporter  41.82 
 
 
457 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  37.36 
 
 
440 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  38.65 
 
 
435 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 
444 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  36.81 
 
 
441 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  38.65 
 
 
437 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  34.97 
 
 
432 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  40.88 
 
 
443 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  37.8 
 
 
451 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2524  major facilitator transporter  46 
 
 
436 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0407  major facilitator transporter  36.48 
 
 
427 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  36.05 
 
 
442 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  43.12 
 
 
434 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  37.88 
 
 
444 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  41.03 
 
 
452 aa  98.2  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 
430 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  34.76 
 
 
441 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.74 
 
 
454 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  37.65 
 
 
432 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  34.15 
 
 
441 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  34.3 
 
 
443 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  42.77 
 
 
439 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.5 
 
 
434 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  37.8 
 
 
435 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.03 
 
 
443 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 
444 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5738  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 
445 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  37.87 
 
 
442 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49260  major facilitator family transporter  38.65 
 
 
433 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  45.91 
 
 
442 aa  95.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  35.19 
 
 
436 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  40.78 
 
 
440 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 
444 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  38.65 
 
 
440 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.25 
 
 
434 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  37.8 
 
 
442 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  37.5 
 
 
442 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4099  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
454 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.307477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.91 
 
 
444 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3986  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
454 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.214427  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  34.36 
 
 
462 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  33.56 
 
 
459 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.25 
 
 
434 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  37.75 
 
 
434 aa  92  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 
439 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.25 
 
 
434 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.25 
 
 
434 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.14 
 
 
439 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  41.67 
 
 
433 aa  92  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  41.67 
 
 
433 aa  91.7  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  37.04 
 
 
436 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.14 
 
 
439 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  40.38 
 
 
441 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  91.94 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  40.38 
 
 
441 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5094  major facilitator transporter  44.79 
 
 
436 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0811378  normal  0.190217 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  34.5 
 
 
441 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  40.38 
 
 
441 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  39.74 
 
 
441 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  39.74 
 
 
441 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
445 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  40.74 
 
 
445 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 
445 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  39.74 
 
 
441 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  39.1 
 
 
469 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5900  major facilitator transporter  35.85 
 
 
442 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5536  major facilitator transporter  35.85 
 
 
442 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  33.92 
 
 
441 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  35.42 
 
 
445 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4703  major facilitator transporter  36.24 
 
 
474 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28443  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  39.87 
 
 
441 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2646  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
453 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  39.22 
 
 
440 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>