More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3217 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  67.44 
 
 		 332 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.8 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  37.05 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.89 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  43.69 
 
 		 341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  43.2 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.14 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  43.64 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.6 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.54 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  41.84 
 
 		 326 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  39.18 
 
 		 326 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.01 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  39.33 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.37 
 
 		 329 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  41.41 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40.18 
 
 		 698 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.36 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  39.53 
 
 		 331 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  39.6 
 
 		 325 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  41.87 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.09 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  40.72 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.32 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.44 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.53 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.66 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  41.36 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  40.44 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  42.05 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.2 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.36 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  40.79 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.26 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.1 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.08 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  35.95 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  39.38 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  40.19 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.21 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  37.02 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.16 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.63 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  38.86 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  39.29 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.08 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  39.25 
 
 		 344 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  41.34 
 
 		 353 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.36 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.66 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 		 331 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  39.1 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  36.88 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  38.91 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.93 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  40.07 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  37.88 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  38.81 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.05 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.44 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  40.07 
 
 		 684 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.02 
 
 		 325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  38.69 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  38.75 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  36.42 
 
 		 332 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.49 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  41.18 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  39.33 
 
 		 337 aa  212  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  41.28 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  36.81 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.3 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  38.93 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2897  hypothetical protein  40.43 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  36.59 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  39.5 
 
 		 325 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  36.96 
 
 		 346 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  42.09 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  39.27 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  39.5 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  36.54 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  40.74 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  39.46 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4820  hypothetical protein  37.67 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  35.76 
 
 		 325 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  39.59 
 
 		 324 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.87 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  39.47 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.59 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  35.47 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  39.74 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  37.12 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.1 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.36 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0792  hypothetical protein  39.67 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.74 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  38.44 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  36.18 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>