More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0792 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0792  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4073  hypothetical protein  82.77 
 
 
325 aa  531  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3417  hypothetical protein  83.08 
 
 
325 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0432  hypothetical protein  82.45 
 
 
323 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2546  hypothetical protein  70.15 
 
 
324 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.530623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3813  hypothetical protein  73.23 
 
 
325 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.369508  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.05 
 
 
330 aa  276  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.85 
 
 
330 aa  275  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.34 
 
 
331 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.51 
 
 
339 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.38 
 
 
328 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.98 
 
 
330 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  46.47 
 
 
326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  46.15 
 
 
335 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  45.79 
 
 
324 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  43.12 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  44.97 
 
 
322 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.07 
 
 
345 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.07 
 
 
345 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.67 
 
 
327 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.46 
 
 
326 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.06 
 
 
335 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  44.59 
 
 
329 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  43.18 
 
 
330 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  45.08 
 
 
324 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  44.1 
 
 
329 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.92 
 
 
324 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  48.28 
 
 
323 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.54 
 
 
333 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.44 
 
 
327 aa  248  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.51 
 
 
327 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.2 
 
 
336 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.49 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.51 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  44.14 
 
 
328 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.96 
 
 
328 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  44.44 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.85 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.91 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  45.25 
 
 
322 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  41.05 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  43.53 
 
 
320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 
331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40 
 
 
346 aa  242  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  42.59 
 
 
336 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  44.11 
 
 
317 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  43.27 
 
 
337 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  42.38 
 
 
327 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.95 
 
 
331 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  42.95 
 
 
327 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  45.21 
 
 
328 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.67 
 
 
321 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.62 
 
 
325 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  42.37 
 
 
329 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.5 
 
 
349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  43.03 
 
 
331 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.07 
 
 
332 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.52 
 
 
325 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.09 
 
 
336 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.01 
 
 
326 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  43.88 
 
 
341 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.82 
 
 
318 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  42.9 
 
 
331 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  43.03 
 
 
328 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.03 
 
 
325 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.99 
 
 
323 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  42.09 
 
 
341 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43 
 
 
360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.96 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  43.05 
 
 
325 aa  236  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.74 
 
 
326 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  43.3 
 
 
327 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.76 
 
 
328 aa  235  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  43.39 
 
 
314 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.37 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.75 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.76 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  41.25 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.75 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 
339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.24 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.29 
 
 
356 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  40.79 
 
 
330 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.92 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.85 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.1 
 
 
322 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  40 
 
 
323 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  42.95 
 
 
326 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  44.59 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  40 
 
 
323 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  41.49 
 
 
326 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  41.5 
 
 
332 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  40.65 
 
 
312 aa  231  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.33 
 
 
337 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.17 
 
 
331 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.1 
 
 
328 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.12 
 
 
322 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  40.43 
 
 
338 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  38.65 
 
 
325 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.24 
 
 
320 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>