More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0432 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0432  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4073  hypothetical protein  79.69 
 
 
325 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3417  hypothetical protein  79.38 
 
 
325 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0792  hypothetical protein  82.61 
 
 
326 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3813  hypothetical protein  70.13 
 
 
325 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.369508  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2546  hypothetical protein  68.54 
 
 
324 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.530623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.79 
 
 
331 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.64 
 
 
330 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.92 
 
 
330 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.67 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.36 
 
 
328 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.91 
 
 
330 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.93 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.1 
 
 
345 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.1 
 
 
345 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.39 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.79 
 
 
336 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.13 
 
 
327 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  43.22 
 
 
327 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  43.52 
 
 
322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.73 
 
 
325 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.31 
 
 
333 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  42.91 
 
 
341 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 
328 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  40.57 
 
 
322 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.62 
 
 
328 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  41.3 
 
 
330 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  41.21 
 
 
341 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  44.27 
 
 
328 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.56 
 
 
324 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.76 
 
 
324 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 
331 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.27 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  40.91 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  42.91 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  43.24 
 
 
329 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  43.39 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.45 
 
 
326 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.62 
 
 
328 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.44 
 
 
335 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.62 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  43.05 
 
 
317 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.17 
 
 
323 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  44.26 
 
 
334 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  42.47 
 
 
331 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  39.55 
 
 
326 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  42.42 
 
 
337 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 
334 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  40.48 
 
 
329 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.84 
 
 
327 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  40.4 
 
 
330 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.04 
 
 
326 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  41.3 
 
 
336 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  39.81 
 
 
323 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  42.14 
 
 
320 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.41 
 
 
339 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.51 
 
 
339 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  40.82 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.5 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.12 
 
 
328 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.76 
 
 
339 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.99 
 
 
331 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  40.19 
 
 
325 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  39.18 
 
 
324 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  41.36 
 
 
327 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.84 
 
 
323 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.8 
 
 
328 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  41.16 
 
 
325 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 
341 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  42.42 
 
 
351 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  38.31 
 
 
334 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.2 
 
 
325 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  41.16 
 
 
323 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 
322 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  40.68 
 
 
331 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  40.13 
 
 
333 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.06 
 
 
336 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  40.48 
 
 
325 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 
358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.47 
 
 
325 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.81 
 
 
327 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  41.55 
 
 
339 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.43 
 
 
330 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  39.13 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  43 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  40.14 
 
 
339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.34 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  39.06 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.55 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.94 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.67 
 
 
360 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  40.28 
 
 
323 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  39.87 
 
 
420 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  42.04 
 
 
320 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  41.98 
 
 
330 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  37.54 
 
 
321 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  39.76 
 
 
327 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.66 
 
 
341 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  39.51 
 
 
333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  39.86 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>