120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2211 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2211  putative fimbrial assembly protein PilM  100 
 
 		 338 aa  692    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0494423  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  50.3 
 
 		 367 aa  331  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002322  type IV pilus biogenesis protein PilM  50.75 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.17332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2716  fimbrial assembly protein PilM  39.82 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  25.58 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  25 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  24.07 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  26.29 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  25.93 
 
 		 355 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  25.36 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  24.93 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  25.35 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  22.92 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.13 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  26.3 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.83 
 
 		 354 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  24.43 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  24.63 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.83 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  25.88 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  25.57 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  24.48 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  24.29 
 
 		 355 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  25.56 
 
 		 350 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  25.51 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  25.86 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.16 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  23.77 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  22.61 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  24.19 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  23.98 
 
 		 361 aa  92.4  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  25.15 
 
 		 359 aa  92.4  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  24.2 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  25.33 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  23.15 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  26.02 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  25.15 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  25.57 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  25.24 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  24.67 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  24.42 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.93 
 
 		 359 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  22.9 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  25.95 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.38 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  23.7 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  23.72 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  24.35 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  22.54 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  24.92 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  23.12 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  23.12 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  24.05 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  22.9 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  22.92 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  22.92 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  23.3 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  24.86 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  25.71 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  26.45 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  23.48 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  23.47 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  25.07 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.42 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  21.34 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  22.64 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  20.64 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  22.34 
 
 		 378 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  24.13 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  24.1 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  21.74 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  20.99 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  21.45 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2556  hypothetical protein  24.15 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  24.05 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.89 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.89 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  22.95 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  20.7 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  18.67 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  22.38 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  20.3 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  20.74 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  21.41 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  22.42 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0076  type IV pilus assembly protein PilM  23.42 
 
 		 749 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  20.78 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>