139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00515 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  100 
 
 		 355 aa  734    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  45.84 
 
 		 376 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  36.31 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  33.89 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  32.77 
 
 		 359 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  32.78 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  31.84 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  31.94 
 
 		 359 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  32.78 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  31.67 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  31.67 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  31.39 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  31.39 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  31.09 
 
 		 359 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  31.09 
 
 		 359 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  30.81 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  30.53 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 355 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  31.37 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  32.49 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  33.43 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  30 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  31.34 
 
 		 355 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  34.28 
 
 		 354 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  35.13 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  32.48 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  33.71 
 
 		 354 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  33.71 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  31.05 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  32.49 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  35.13 
 
 		 354 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  35.04 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  32.08 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  34.1 
 
 		 351 aa  182  7e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  34.1 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  31.27 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  30.61 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  30.99 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  29.38 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  31.34 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  31.41 
 
 		 380 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  30.42 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  30.51 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  31.62 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  31.34 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  33.04 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  28.37 
 
 		 361 aa  169  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  29.94 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  33.71 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  33.71 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  30.45 
 
 		 359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  31.34 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  30.61 
 
 		 345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  30.17 
 
 		 352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  31.52 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  29.58 
 
 		 359 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  31.52 
 
 		 350 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  30 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  28.69 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  30 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  30.84 
 
 		 350 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.82 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  30.7 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  30.11 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  28.69 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  28.37 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  32.49 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  28.21 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  28.21 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  27.22 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  27.92 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  27.49 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  30.37 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  26.73 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  25.21 
 
 		 354 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  26.32 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  26.69 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3135  Type IV pilus assembly protein PilM  26.65 
 
 		 367 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3272  type IV pilus assembly protein PilM  26.36 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  26.86 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0396  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  26.79 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917562 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002322  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.41 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.17332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  27.08 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  26.07 
 
 		 361 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  25.79 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2211  putative fimbrial assembly protein PilM  26.44 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0494423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.01 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  20.51 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  24.68 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  20.81 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2716  fimbrial assembly protein PilM  23.84 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  20.88 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  22.78 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  23.14 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  23.26 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  25.32 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  25.32 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  21.59 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  23.55 
 
 		 594 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>