164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1465 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 
379 aa  720    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  33.79 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  30.66 
 
 
348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  29.44 
 
 
354 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  31.71 
 
 
354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  27.78 
 
 
351 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  31.62 
 
 
353 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  27.22 
 
 
351 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  31.2 
 
 
379 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  27.5 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  31.17 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  31.34 
 
 
348 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  26.45 
 
 
352 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  26.52 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  30.14 
 
 
353 aa  130  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  30.79 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  28.42 
 
 
392 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  27.35 
 
 
352 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  25.56 
 
 
350 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  25.56 
 
 
350 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  25.97 
 
 
350 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  23.89 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  23.82 
 
 
351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0953  type IV pilus assembly protein PilM  31.61 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  27.57 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  27.61 
 
 
354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  26.01 
 
 
353 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  26.81 
 
 
358 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  27.2 
 
 
380 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  23.63 
 
 
350 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  25.66 
 
 
347 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.3 
 
 
352 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  26.16 
 
 
354 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  26.16 
 
 
354 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  26.23 
 
 
362 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  26.88 
 
 
355 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  29.45 
 
 
300 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  22.71 
 
 
352 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  27.08 
 
 
355 aa  97.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  25.88 
 
 
356 aa  96.3  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  24.53 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  25.07 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.26 
 
 
359 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  26.32 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  25.91 
 
 
325 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  26.15 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  24.46 
 
 
355 aa  92.8  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  25.47 
 
 
358 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  29.97 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  26.93 
 
 
356 aa  90.9  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  25.07 
 
 
361 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  26.03 
 
 
352 aa  87  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  27.35 
 
 
334 aa  86.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  24.67 
 
 
355 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  24.38 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  25.62 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  25.48 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  27.84 
 
 
594 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  32.92 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  23.56 
 
 
359 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  24.46 
 
 
359 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  32.3 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  25.57 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  22.61 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  22.77 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  23.44 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  25.43 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.49 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  24.65 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  22.07 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  25.37 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  21.61 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  24.65 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  21.81 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  22.07 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  22.07 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002322  type IV pilus biogenesis protein PilM  25.68 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.17332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  22.68 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  23.32 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  22.61 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  27.95 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  28.38 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3285  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.7 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  28.31 
 
 
354 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  28.38 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  27.1 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  24.46 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  23.96 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  21.16 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.16 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  23.92 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  26.79 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  26.36 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  22.4 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  21.16 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  21.16 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  23.35 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>