236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2032 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  100 
 
 		 351 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  84.33 
 
 		 351 aa  622  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  73.71 
 
 		 350 aa  537  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  73.14 
 
 		 350 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  73.71 
 
 		 350 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  64.57 
 
 		 351 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  64.29 
 
 		 352 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  54.26 
 
 		 352 aa  384  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  54.26 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  53.41 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  53.41 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  49.29 
 
 		 354 aa  359  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  43.1 
 
 		 348 aa  291  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  40.06 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  40.94 
 
 		 350 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  39.77 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  35.55 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  35.61 
 
 		 362 aa  212  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  34.66 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  34.67 
 
 		 380 aa  205  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  35.04 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  31.81 
 
 		 353 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  34.77 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  32.66 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  30.77 
 
 		 355 aa  189  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  33.91 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  34.09 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  30.95 
 
 		 359 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  29.8 
 
 		 372 aa  185  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  32.67 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  32.76 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  30.66 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  31.81 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  31.81 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  33.24 
 
 		 359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  31.52 
 
 		 355 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  31.81 
 
 		 359 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  31.52 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  30.37 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  30.95 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  30.68 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  29.8 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  31.5 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  32.18 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  33.52 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  28.86 
 
 		 355 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  33.24 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  30.99 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  29.8 
 
 		 359 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  31.23 
 
 		 359 aa  176  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  29.51 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  29.51 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  34.3 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  30.91 
 
 		 379 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  29.23 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  32.1 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  29.81 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  32.09 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  30.37 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  32.95 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  31.91 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  31.81 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  31.81 
 
 		 352 aa  169  7e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  28.41 
 
 		 354 aa  165  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  28.41 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  31.34 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  29.64 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  30 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  31.43 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  31.53 
 
 		 358 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  30.26 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  29.91 
 
 		 362 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  31.05 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  31.05 
 
 		 354 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  30.97 
 
 		 359 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  30.57 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  31.43 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  28.74 
 
 		 354 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  28.82 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  28.06 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  32.69 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  29.48 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  28.77 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  28.12 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  27.22 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  28.22 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  28.37 
 
 		 347 aa  129  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  26.23 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  24.46 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  26.24 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  26.27 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  26.47 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  30.66 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  26.13 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  26.13 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  27.63 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  24.29 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  27.22 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  25.83 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  25.64 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>