84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2556 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2556  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  651    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0893  hypothetical protein  63.38 
 
 		 312 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  23.24 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  24.38 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  23.24 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0307  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  26.01 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  26.16 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  22.71 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.94 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.81 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  24.49 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  22.06 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  20.77 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2565  type IV pilus assembly protein PilM  22.49 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  22.34 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.14 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  21 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1140  Tfp pilus assembly protein ATPase  24.28 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0194747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  23.58 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  21.32 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  24.53 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1170  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.05 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00808217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  20.5 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002322  type IV pilus biogenesis protein PilM  20.96 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.17332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  20.98 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  24.23 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1358  type IV pilus assembly family protein  23.46 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.590178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  22.36 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  27.01 
 
 		 378 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  27.75 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  27.75 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  22.78 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  23.73 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  25.2 
 
 		 365 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  27.46 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  21.18 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  18.73 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.53 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  18.73 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  26.76 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  22.11 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  25.66 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  19.35 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  21.14 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  25.58 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  23.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  21.45 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  29.21 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  24.21 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  20.07 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  20.19 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  23.7 
 
 		 358 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  21.56 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  21.25 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  22.43 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  21.9 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  20.57 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  19.58 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  19.33 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  21.12 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  20.9 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  21.19 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4610  hypothetical protein  23.33 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2211  putative fimbrial assembly protein PilM  24.15 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0494423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  23.33 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2092  hypothetical protein  24.44 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  22.36 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0539  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.8 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3135  Type IV pilus assembly protein PilM  26.87 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  22.27 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  19.67 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  20.2 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  19.55 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2716  fimbrial assembly protein PilM  19.86 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0119  hypothetical protein  23.89 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  24.41 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  21.83 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  23.14 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0255  hypothetical protein  24.57 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3272  type IV pilus assembly protein PilM  23.31 
 
 		 361 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 		 362 aa  42.7  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>