196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2461 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 
356 aa  730    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  56.55 
 
 
361 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  56.53 
 
 
358 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  55.62 
 
 
362 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  48.58 
 
 
355 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  49.29 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  46.33 
 
 
372 aa  347  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  48.43 
 
 
359 aa  346  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  48.15 
 
 
359 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  49.13 
 
 
358 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  49.27 
 
 
345 aa  340  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  48.43 
 
 
356 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  47.29 
 
 
359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  48.15 
 
 
356 aa  339  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  48.15 
 
 
359 aa  336  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  47.75 
 
 
354 aa  335  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  47.86 
 
 
359 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  48.1 
 
 
352 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  47.58 
 
 
359 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  48.16 
 
 
354 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  49.01 
 
 
354 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  48.87 
 
 
354 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  47.54 
 
 
352 aa  316  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  43.3 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  48.59 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  44.35 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  47.16 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  47.16 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  44.6 
 
 
352 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  44.32 
 
 
352 aa  299  5e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  45.17 
 
 
360 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  44.77 
 
 
354 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  44.48 
 
 
354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  46.08 
 
 
318 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  41.76 
 
 
351 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  41.48 
 
 
351 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  40.7 
 
 
355 aa  269  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  38.46 
 
 
359 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  36.75 
 
 
359 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  36.06 
 
 
359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  37.82 
 
 
356 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  37.32 
 
 
359 aa  235  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  35.33 
 
 
359 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  37.43 
 
 
365 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  34.65 
 
 
359 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  35.11 
 
 
359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  35.11 
 
 
359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  35.11 
 
 
359 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  35.67 
 
 
359 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  38.04 
 
 
354 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  34.83 
 
 
359 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  34.93 
 
 
359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  34.93 
 
 
359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  34.83 
 
 
359 aa  223  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  35.77 
 
 
359 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  34.55 
 
 
359 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  34.07 
 
 
359 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  36.31 
 
 
361 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  36.02 
 
 
361 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  34.87 
 
 
356 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  32.48 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  33.81 
 
 
351 aa  189  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  31.2 
 
 
354 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  32.67 
 
 
350 aa  185  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  32.67 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  33.33 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  32.55 
 
 
354 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  31.41 
 
 
351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  32.18 
 
 
352 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  32.18 
 
 
352 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3135  Type IV pilus assembly protein PilM  35.26 
 
 
367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3272  type IV pilus assembly protein PilM  34.94 
 
 
361 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  33.06 
 
 
352 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  32.76 
 
 
352 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  31.93 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  31.16 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  29.31 
 
 
351 aa  162  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0396  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  29.6 
 
 
332 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000917562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  30 
 
 
348 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  30.84 
 
 
350 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  29.23 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  24.38 
 
 
376 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  28.81 
 
 
325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  27.17 
 
 
379 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  27.06 
 
 
378 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  27.58 
 
 
350 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  26.3 
 
 
367 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  25.72 
 
 
392 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  26.82 
 
 
348 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002322  type IV pilus biogenesis protein PilM  26.74 
 
 
338 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.17332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2716  fimbrial assembly protein PilM  24.86 
 
 
332 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 
354 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  26.71 
 
 
293 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  26.93 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  26.55 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  31.31 
 
 
282 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.21 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2211  putative fimbrial assembly protein PilM  25 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0494423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  24.6 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  26.42 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>