80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1140 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1170  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  89.48 
 
 		 485 aa  898    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00808217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1140  Tfp pilus assembly protein ATPase  100 
 
 		 485 aa  981    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0194747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1358  type IV pilus assembly family protein  87.22 
 
 		 485 aa  872    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.590178  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  28.52 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  29.32 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  29.32 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  31.25 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  28.5 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  26.39 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  27.07 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  25.93 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  27.85 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  27.97 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  28.79 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2556  hypothetical protein  24.28 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  24.68 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  24.88 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  27.43 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  29.93 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  28.47 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  22.18 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  29.45 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  28.48 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  30.08 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  23.46 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  29.63 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  25.87 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  25.87 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  30.15 
 
 		 379 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  29.03 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  28.19 
 
 		 354 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  23.6 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  26.54 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  29.2 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  27.15 
 
 		 351 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  28.89 
 
 		 345 aa  53.9  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  26.71 
 
 		 352 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0184  type IV pilus assembly protein PilM  25.31 
 
 		 367 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000394027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  24.48 
 
 		 358 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0893  hypothetical protein  22.92 
 
 		 312 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  23.22 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0953  type IV pilus assembly protein PilM  25.18 
 
 		 345 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  23.27 
 
 		 353 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  25.95 
 
 		 354 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  26.53 
 
 		 351 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  24.02 
 
 		 353 aa  51.2  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  25.5 
 
 		 380 aa  51.2  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0076  type IV pilus assembly protein PilM  27.97 
 
 		 749 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  22.02 
 
 		 350 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  25.19 
 
 		 351 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  26.52 
 
 		 351 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  23.31 
 
 		 347 aa  50.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  28.15 
 
 		 352 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  26.49 
 
 		 361 aa  50.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  29.11 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  33.33 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  23.95 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  23.33 
 
 		 350 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  21.03 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  23.62 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  28.57 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  27.78 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  28.07 
 
 		 594 aa  48.5  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  26.39 
 
 		 351 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  28.23 
 
 		 350 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  26.45 
 
 		 359 aa  47.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  28.89 
 
 		 359 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0539  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.71 
 
 		 353 aa  47  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  22.84 
 
 		 367 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  28.57 
 
 		 362 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4956  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  25.58 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  26.53 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  28.15 
 
 		 356 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5083  type IV pili biogenesis protein PilM, putative  24.65 
 
 		 293 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  27.41 
 
 		 356 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  28.08 
 
 		 353 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  23.14 
 
 		 351 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0307  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  25 
 
 		 322 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  23.53 
 
 		 282 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  24.68 
 
 		 355 aa  43.5  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>