155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2409 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 351 aa  712    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  30.52 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  30.84 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  28.08 
 
 		 371 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  27.95 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0184  type IV pilus assembly protein PilM  26.52 
 
 		 367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2565  type IV pilus assembly protein PilM  28.05 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  26 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  25.43 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  26.29 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  22.12 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.93 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.29 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  23.1 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  26.73 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  24.72 
 
 		 352 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.1 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.1 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  24.43 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.55 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  22.47 
 
 		 351 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  24.43 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  23.55 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  25.07 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  23.53 
 
 		 351 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  23.71 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  23.87 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  24.15 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  23.29 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  23.38 
 
 		 351 aa  95.9  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  22.41 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  23.66 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  24.23 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  21.94 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  23.25 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  24.54 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  22.94 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.03 
 
 		 380 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  20.98 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  21.6 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  23.91 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  24.3 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  22.56 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  23.1 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  24.52 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  24.46 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  23.87 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  22.6 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  23.79 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  23.78 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  21.61 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  23.53 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  24.06 
 
 		 594 aa  80.5  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0539  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.07 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  23.44 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  21.64 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  21.85 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  23.2 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  21.36 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  21.71 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  22 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.51 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.51 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  22.1 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  21.31 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  22.26 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  20.96 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  20.96 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  23.05 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  21.43 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  21.52 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  22.51 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.24 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  21.75 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  23.08 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3549  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  25.49 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  22.15 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.57 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  25.08 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  18.77 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  23.53 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  19.78 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  24.36 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  21.31 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.01 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  21.35 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  20.13 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  20.13 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  23.9 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1875  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.69 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  22.04 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2556  hypothetical protein  20.77 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  20.83 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  19.32 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  18.05 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  23.16 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  20.62 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  20 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>