73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3549 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3549  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  100 
 
 		 353 aa  728    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  25.43 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  25.49 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0184  type IV pilus assembly protein PilM  22.04 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000394027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  25.63 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  22.74 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  22.38 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  20.08 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2565  type IV pilus assembly protein PilM  20 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  22.73 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  19.93 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  22.85 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  24.56 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  23.27 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  20.58 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.36 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  25.17 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  25.34 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  23.71 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  20.41 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  19.47 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.19 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  20.22 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  21.93 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  22.59 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  21.19 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.55 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.55 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0307  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.5 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  22.92 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  22.51 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  19.57 
 
 		 351 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  23.6 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  23.55 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  20.16 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  25.62 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  25.62 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  23.66 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  23.55 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  24.92 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  25.9 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  22.67 
 
 		 350 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  22.17 
 
 		 300 aa  49.7  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  26.27 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  23.65 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  24.09 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  22.53 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  21.35 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.12 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  23.76 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  21.86 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.16 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  21.16 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  20.42 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  25.61 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  21.16 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  23.83 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  21.16 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  20.85 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  20.39 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  22.52 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  18.67 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  21.74 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  21.38 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  23.05 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  20.92 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2701  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  20.25 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.942967 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  23.14 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  22.36 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  25.15 
 
 		 362 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  25.15 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  21.34 
 
 		 594 aa  42.7  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>