85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0307 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0307  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  100 
 
 
322 aa  653    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0893  hypothetical protein  28.91 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2556  hypothetical protein  26.01 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.41 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1726  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.32 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.221742  normal  0.0452005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.23 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.11 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  23.78 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  23.67 
 
 
350 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  28.47 
 
 
345 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  30.71 
 
 
359 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  28.57 
 
 
361 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 
348 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  25.23 
 
 
374 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  27.45 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  26.39 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  24.26 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  28.4 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  19.91 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  26.85 
 
 
352 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  26.8 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  19.64 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  20.21 
 
 
351 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  24.31 
 
 
358 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3135  Type IV pilus assembly protein PilM  27.17 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  23.16 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  25.67 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  21.13 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  27.06 
 
 
379 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  29.2 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  19.82 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  24.79 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  24.79 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  26.62 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  28.06 
 
 
359 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3549  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.5 
 
 
353 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  23.21 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3272  type IV pilus assembly protein PilM  26.59 
 
 
361 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 
372 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  24.23 
 
 
354 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.4 
 
 
331 aa  52.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  24.79 
 
 
354 aa  52.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  20.83 
 
 
352 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  20.44 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  23.7 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  27.22 
 
 
362 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  24.26 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0953  type IV pilus assembly protein PilM  23.08 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  22.98 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  20.34 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3003  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  25.23 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  25 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  23.66 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  18.87 
 
 
356 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  29.66 
 
 
374 aa  50.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  23.85 
 
 
347 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  21.07 
 
 
351 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  20 
 
 
350 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1280  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  25.39 
 
 
305 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  25.69 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  22.52 
 
 
368 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  27.66 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2701  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.81 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.942967 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1677  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  32.41 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  24.19 
 
 
356 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  21.08 
 
 
353 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2849  fimbrial assembly family protein  25.17 
 
 
560 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996397  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  24.35 
 
 
380 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  20.6 
 
 
367 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1358  type IV pilus assembly family protein  25.6 
 
 
485 aa  45.8  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.590178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  27.07 
 
 
343 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  25.71 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  25.79 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  21.54 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3278  hypothetical protein  22.27 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1875  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.37 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1140  Tfp pilus assembly protein ATPase  25 
 
 
485 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0194747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  19.14 
 
 
350 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  22.35 
 
 
353 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  23.93 
 
 
359 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0575  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.08 
 
 
536 aa  43.1  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  21.28 
 
 
594 aa  42.7  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1170  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.4 
 
 
485 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00808217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2211  putative fimbrial assembly protein PilM  22.85 
 
 
338 aa  42.7  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0494423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>