73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1726 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1726  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  100 
 
 
323 aa  650    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.221742  normal  0.0452005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  26.72 
 
 
347 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  24.78 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  23.03 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.89 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.89 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.36 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  24.21 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  18.27 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  23.94 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  24.11 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  23.08 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  22.92 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0307  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.49 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  26.72 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  23.47 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.29 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  25.74 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  20.44 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  23.53 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  23.89 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  23.59 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  18.47 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  30.39 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  23.87 
 
 
379 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  23.64 
 
 
378 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  21.84 
 
 
354 aa  59.3  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  21.89 
 
 
392 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  22.86 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.37 
 
 
354 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  22.78 
 
 
345 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  19.77 
 
 
379 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  22.87 
 
 
354 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.92 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  18.28 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.42 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  24.87 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1176  Fimbrial assembly family protein  22.74 
 
 
462 aa  53.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  28.66 
 
 
356 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  20.11 
 
 
359 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  29.56 
 
 
356 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0733  Fimbrial assembly family protein  22.6 
 
 
571 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  21.26 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  21.97 
 
 
369 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  21.97 
 
 
369 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0893  hypothetical protein  20.95 
 
 
312 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  20.67 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  22.79 
 
 
369 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  21.81 
 
 
356 aa  49.3  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  28.96 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5083  type IV pili biogenesis protein PilM, putative  20.67 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1677  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.23 
 
 
316 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  21.69 
 
 
358 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  21.15 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  21.08 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4956  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  20.67 
 
 
293 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  28.65 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  21.98 
 
 
361 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  21.97 
 
 
362 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  18.94 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  19.57 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1170  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.35 
 
 
485 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00808217  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  22.8 
 
 
356 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0539  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.46 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  23.33 
 
 
374 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3285  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  17.76 
 
 
415 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  21.7 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  19.9 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  17.43 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.32 
 
 
359 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 
359 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  24.55 
 
 
359 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  27.78 
 
 
331 aa  42.7  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>