30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1047 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  100 
 
 
315 aa  645    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  25.88 
 
 
378 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0539  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.81 
 
 
353 aa  63.2  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  25.52 
 
 
379 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  31.71 
 
 
392 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1726  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24 
 
 
323 aa  59.3  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.221742  normal  0.0452005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  20.81 
 
 
354 aa  57.4  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  23.56 
 
 
362 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  19.51 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  20.07 
 
 
352 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  19.55 
 
 
352 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  20.37 
 
 
351 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3285  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  19.2 
 
 
415 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  26.62 
 
 
374 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.43 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  20.57 
 
 
351 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  21.9 
 
 
350 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  19.19 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  24.09 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  20 
 
 
365 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  24.49 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  21.61 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  23.76 
 
 
347 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  24.43 
 
 
594 aa  46.2  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  23.55 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  23.86 
 
 
282 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  32.11 
 
 
383 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  24.14 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  25.15 
 
 
293 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  26.87 
 
 
354 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>