182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0333 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 351 aa  714    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  42.17 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  40.34 
 
 		 352 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  40.06 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  39.77 
 
 		 351 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  40.06 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  38 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  41.13 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  40.85 
 
 		 350 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  39.2 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  40.51 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  39.77 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  37.71 
 
 		 350 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  39.03 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  37.96 
 
 		 350 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  34.78 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  32.96 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  32.19 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  32.31 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  31.28 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  32.03 
 
 		 362 aa  179  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  28.21 
 
 		 372 aa  179  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  31.93 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  30.9 
 
 		 354 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  30.9 
 
 		 354 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  30.99 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  33.52 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  29.86 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  28.09 
 
 		 355 aa  169  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  29.26 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  29.11 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  29.3 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  29.18 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  29.97 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  29.31 
 
 		 356 aa  162  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  29.13 
 
 		 359 aa  162  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  28.81 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  27.17 
 
 		 380 aa  159  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  28.86 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  29.13 
 
 		 356 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  28.85 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  29.14 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  28.53 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  29.26 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  27.82 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  28.45 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  28 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  26.76 
 
 		 378 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  30.09 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  27.76 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  26.09 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  29.94 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  29.38 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  25.8 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  24.02 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  27.35 
 
 		 354 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  27.35 
 
 		 362 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  27.61 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  26.67 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  26.09 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.17 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  27.89 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  26.4 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  26.93 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  25.22 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  25.22 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  25.22 
 
 		 359 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  26.1 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  25.22 
 
 		 359 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  25.22 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  24.93 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.93 
 
 		 359 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  27.86 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  24.64 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  24.93 
 
 		 359 aa  135  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.79 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  25.22 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  24.06 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  24.35 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  27.06 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  26.38 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  26.69 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  27.71 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  26.15 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  25.29 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 353 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  24.23 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  22.79 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  24.5 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2565  type IV pilus assembly protein PilM  24.45 
 
 		 371 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  25 
 
 		 367 aa  106  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  23.87 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  22.66 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  24.76 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  24.92 
 
 		 368 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  25.07 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002322  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.71 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.17332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  22.93 
 
 		 374 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  24.12 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>