172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3023 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 353 aa  721    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  59.71 
 
 		 372 aa  443  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  62.57 
 
 		 355 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  59.89 
 
 		 354 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  62.36 
 
 		 352 aa  431  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  62.99 
 
 		 354 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  61.71 
 
 		 354 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  56.98 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  62.82 
 
 		 354 aa  417  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  61.43 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  61.02 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  62.54 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  58.57 
 
 		 352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  58.57 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  55.24 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  55.81 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  56.57 
 
 		 360 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  50.85 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  49.14 
 
 		 361 aa  361  8e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  58.93 
 
 		 318 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  49.29 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  49.15 
 
 		 358 aa  352  7e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  45.71 
 
 		 359 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  46.4 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  46.11 
 
 		 354 aa  316  5e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  44.29 
 
 		 359 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  44.57 
 
 		 356 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  42.57 
 
 		 359 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  46.57 
 
 		 351 aa  310  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  44.29 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  44.83 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  44.57 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  46.29 
 
 		 351 aa  308  8e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  42.07 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  43.15 
 
 		 345 aa  299  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  42.29 
 
 		 359 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  42.24 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  41.43 
 
 		 359 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  42.98 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  41.26 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  41.43 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  41.26 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  40.97 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  40.97 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  40.97 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  40.11 
 
 		 359 aa  278  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  41.43 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  41.14 
 
 		 359 aa  276  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  40.69 
 
 		 359 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  40.4 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  40.4 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  40.11 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  42.22 
 
 		 365 aa  272  6e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  40.4 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  39.83 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  41.43 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  37.39 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  34.2 
 
 		 354 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  33.43 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  34.96 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  34.96 
 
 		 361 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  33.15 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  33.88 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  33.43 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  33.81 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  32.19 
 
 		 351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  31.81 
 
 		 351 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3135  Type IV pilus assembly protein PilM  35.06 
 
 		 367 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3272  type IV pilus assembly protein PilM  34.2 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  32.66 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  32.17 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  32.17 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  32.02 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  30.37 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  33.03 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  30.66 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  30.4 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  28.94 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  32.38 
 
 		 350 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  29.43 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0396  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  31.06 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  31.61 
 
 		 348 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  26.12 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  28 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.56 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  26.93 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  33.89 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  26.01 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  26.43 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  26.18 
 
 		 367 aa  106  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  26.67 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  25.14 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  35.29 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  25.07 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002322  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.41 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.17332  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  24.72 
 
 		 354 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  25.91 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  23.85 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  23.85 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  26.45 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>