155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2269 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2565  type IV pilus assembly protein PilM  93.53 
 
 		 371 aa  664    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21665  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 371 aa  733    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  28.08 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  30.57 
 
 		 319 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  26.04 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  26.7 
 
 		 368 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  26.97 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  23.6 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0184  type IV pilus assembly protein PilM  27.16 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000394027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.84 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.84 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  22.88 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.4 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  22.7 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  25.22 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  25.8 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  22.74 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  23.48 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  22.61 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  24.76 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  23.86 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  22.61 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  22.32 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.39 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.48 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  22.48 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  22.61 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  23.28 
 
 		 359 aa  99.8  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  21.14 
 
 		 361 aa  99.4  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  24 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  23.22 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  25.08 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  24.76 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  23.69 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  23.6 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  20.87 
 
 		 359 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  23.58 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  19.05 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  22.13 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  22.12 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  23.99 
 
 		 594 aa  92.4  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  22.93 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  21.76 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  21.04 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  21.65 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  22.4 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  22.82 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  24.6 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  20.99 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  21.52 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  20.71 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  23.33 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  21.89 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  19 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  20.63 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.28 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  20.06 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  22.68 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  19.35 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.28 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0076  type IV pilus assembly protein PilM  22.39 
 
 		 749 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  20.87 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  20.86 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  19.88 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  21.78 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  21.12 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  18.42 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  20.74 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  19.94 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  21.12 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  22.26 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.49 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  21.57 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  19.43 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  18.52 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  21.74 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  20.98 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  20.98 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  19.16 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  20.98 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3549  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  20.08 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  21.02 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.53 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  21.22 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1875  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.5 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.44 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2556  hypothetical protein  21.32 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  19 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  20.63 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  21.49 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  20.77 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  20.22 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  18.73 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  20.75 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  20.13 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  18.71 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0539  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.23 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  21.2 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  21.2 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  22.66 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>