184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3019 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 348 aa  681    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  53.67 
 
 		 354 aa  345  5e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  45.09 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  39.94 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  41.71 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  37.86 
 
 		 383 aa  165  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  30.84 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  30.84 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  30.66 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  30.41 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  29.36 
 
 		 351 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  29.51 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  28.7 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.94 
 
 		 354 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.12 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  30.23 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  27.83 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  27.25 
 
 		 351 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  28.2 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  26.09 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  27.06 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  27.8 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  26.67 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  29.81 
 
 		 358 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  28.44 
 
 		 361 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  28.9 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  29.71 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  29.64 
 
 		 348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  27.57 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  26.89 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  27.76 
 
 		 379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  26.73 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  29.32 
 
 		 380 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  30.21 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  27.02 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  27.37 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  29.94 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  29.39 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  26.69 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  26.35 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  27.55 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  26.35 
 
 		 354 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  30.92 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  26.09 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  27.87 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  26.55 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  26.86 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  28.31 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  26.82 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0953  type IV pilus assembly protein PilM  30.75 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  28.05 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  27.63 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  28.05 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  27.87 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  28.17 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  26.89 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  26.72 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  24.3 
 
 		 347 aa  96.3  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  23.31 
 
 		 354 aa  96.3  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  24.08 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.71 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0539  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.33 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  25.55 
 
 		 354 aa  93.2  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 354 aa  92.8  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  23.99 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  25.97 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  22.82 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  26.22 
 
 		 351 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  25.98 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2565  type IV pilus assembly protein PilM  21.48 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21665  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  26.44 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  26.44 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  24.71 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  20.86 
 
 		 319 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  22.86 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  26.3 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  25.07 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  20.4 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  24.19 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  24.4 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  25.25 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  27.1 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3272  type IV pilus assembly protein PilM  27.58 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3135  Type IV pilus assembly protein PilM  27.86 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  24.49 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  18.16 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  24.93 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  24.58 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  23.55 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  24.17 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  23.55 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  23.02 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  23.98 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.72 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  23.24 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  23.01 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  26.07 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>