184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2686 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 367 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0184  type IV pilus assembly protein PilM  59.45 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000394027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  53.61 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  27.95 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  26.97 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2565  type IV pilus assembly protein PilM  26.12 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  23.73 
 
 		 378 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  22.82 
 
 		 354 aa  106  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.26 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  27.13 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  23.95 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  23.51 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  21.87 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  22.63 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  26.49 
 
 		 350 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  23.24 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  21.08 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.65 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  22.91 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  23.08 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  22.19 
 
 		 352 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.22 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.22 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  23.08 
 
 		 350 aa  89.4  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  22.47 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  23.37 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  23.24 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  21.98 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  19.01 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  22.19 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  20.94 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  19.6 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  20.4 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  21.59 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  18.99 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  21.59 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  21.45 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.05 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  21.73 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  20.62 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  20.8 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  20.87 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  20.32 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  19.57 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  20.06 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  20.86 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  19.2 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  22.29 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  21.67 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3285  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  25.62 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  19.7 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  19.69 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.19 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  22.04 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  21.91 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.88 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  20.56 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  18.7 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  20.18 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  20.31 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  20.62 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  20.44 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  21.88 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  22.26 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  22.63 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  20.81 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  20.06 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  21.81 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  21.67 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  20.94 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  21.25 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3549  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  19.93 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  21.45 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  18.48 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  20.31 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  23.6 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  20.73 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  20.86 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  20.62 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  20.62 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  20.62 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  19.3 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  19.38 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  20.31 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  19.3 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  19.3 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  20.81 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  20.81 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  20.25 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  20.94 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  20 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2009  cell division protein FtsA  21.55 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  21.34 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2616  cell division protein FtsA  26.12 
 
 		 589 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  19.57 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1925  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.51 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  21.78 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  21.78 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3917  cell division protein FtsA  21.78 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  21.82 
 
 		 594 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>