175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0537 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 
350 aa  716    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  42.05 
 
 
351 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  41.93 
 
 
352 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  41.93 
 
 
352 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  40.17 
 
 
351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  39.77 
 
 
351 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  41.93 
 
 
352 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  37.71 
 
 
351 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  39.03 
 
 
350 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  36 
 
 
354 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  38.35 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  39.49 
 
 
351 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  38.07 
 
 
350 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  36.93 
 
 
352 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  32.95 
 
 
350 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  32.76 
 
 
348 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  34.38 
 
 
350 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  33.85 
 
 
325 aa  186  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  32.38 
 
 
353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  30.75 
 
 
380 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  32.59 
 
 
361 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  31.07 
 
 
362 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  30.95 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  31.71 
 
 
355 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  31.9 
 
 
358 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  31.53 
 
 
359 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  30.29 
 
 
359 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  30.55 
 
 
359 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  29.26 
 
 
359 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  29.86 
 
 
359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  29.61 
 
 
356 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  29.14 
 
 
345 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  30.84 
 
 
356 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  30.14 
 
 
359 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  29.33 
 
 
356 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  28.16 
 
 
354 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.77 
 
 
359 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  29.31 
 
 
351 aa  149  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.2 
 
 
354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.2 
 
 
354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  29.34 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  29.34 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  29.34 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  28.61 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  29.06 
 
 
359 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.86 
 
 
359 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  29.34 
 
 
359 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  28.73 
 
 
352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  27.14 
 
 
355 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  29.71 
 
 
359 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  29.31 
 
 
351 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  29.91 
 
 
359 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  32.29 
 
 
354 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  29.86 
 
 
352 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  28.12 
 
 
356 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  25.13 
 
 
392 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  27.84 
 
 
355 aa  142  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  30.79 
 
 
352 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  30.79 
 
 
352 aa  143  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  28.94 
 
 
354 aa  142  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  28.21 
 
 
359 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  29.26 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  28.49 
 
 
359 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  28.71 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  28.71 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  27.79 
 
 
354 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  30.25 
 
 
359 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  27.75 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  27.76 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  28.61 
 
 
360 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  27.48 
 
 
352 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  25.07 
 
 
378 aa  135  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  28.98 
 
 
354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  30.03 
 
 
354 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  27.49 
 
 
355 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  30.03 
 
 
362 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.98 
 
 
354 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  27.17 
 
 
359 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  29.75 
 
 
359 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  27.75 
 
 
343 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  26.61 
 
 
348 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  25.97 
 
 
379 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  25.6 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  28.44 
 
 
354 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  26.59 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  24.86 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  26.63 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  26.57 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  26.09 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  26.72 
 
 
362 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  27.01 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  24.58 
 
 
348 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  27.39 
 
 
318 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  26.45 
 
 
369 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  25.68 
 
 
376 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  28.68 
 
 
594 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0628418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 
369 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 
369 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  25.29 
 
 
334 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>