122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002322 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002322  type IV pilus biogenesis protein PilM  100 
 
 		 338 aa  697    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.17332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  82.84 
 
 		 367 aa  593  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2211  putative fimbrial assembly protein PilM  50.75 
 
 		 338 aa  287  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0494423  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2716  fimbrial assembly protein PilM  37.31 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  25.59 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  26.25 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  25.29 
 
 		 359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.71 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 359 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  24.34 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  24.42 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  25.81 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  25.86 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  26.26 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  25.72 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  24.63 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  26.01 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  26.67 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  26.72 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  26.72 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  26.24 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  24.41 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  24.68 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  26.74 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  26.05 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  25.29 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  26.69 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  24.49 
 
 		 359 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  23.89 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  24.41 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  26.15 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  23.89 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  23.91 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  23.91 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  24.41 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  24.2 
 
 		 355 aa  96.7  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  23.89 
 
 		 359 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  24.2 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  24.35 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  22.71 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  23.19 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  23.81 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  22.9 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  24.05 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  24.07 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  25.51 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  23.03 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.26 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  23.01 
 
 		 372 aa  89.4  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  22.61 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  22.54 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  22.61 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  24.12 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.65 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  22.19 
 
 		 352 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  24.41 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  25.68 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  22.83 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  22.44 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0539  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.7 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  22.08 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  23.08 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  23.94 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  20.45 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  24.78 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  22.12 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  22.12 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  23.2 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  23.46 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  22.65 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  21.49 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  22.85 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  23.68 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  22.86 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  24.19 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  22.51 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.26 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.26 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.68 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  21.34 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  24.72 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  21.14 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  22.47 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2556  hypothetical protein  20.96 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3135  Type IV pilus assembly protein PilM  27.95 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3272  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  21.52 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  20.88 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  21.39 
 
 		 379 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  20.25 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>