110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1031 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  656    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  26.96 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  30.11 
 
 		 352 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  29.53 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  29.53 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  27.02 
 
 		 350 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  25 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  31.76 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  31.25 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.3 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  22.33 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  31.25 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  26.09 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  21.22 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  23.41 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  23.3 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  23.21 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  29.93 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  20.14 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  21.5 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  20.68 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  20.86 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  22.96 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  23.1 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  26.67 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  26.67 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  25.13 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  27.64 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0893  hypothetical protein  22.35 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  23.15 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  21.85 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2409  type IV pilus assembly protein PilM  23.9 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0184  type IV pilus assembly protein PilM  24.1 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000394027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  19.44 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  27.33 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  19.74 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  26.74 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  19.26 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  28.97 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  21.74 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  23.31 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  18.48 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  22.78 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  24.09 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2269  type IV pilus assembly protein PilM  20.77 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  21.25 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  25.54 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.11 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  23.76 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  24.46 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  19.55 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  19.61 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2565  type IV pilus assembly protein PilM  20.77 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21665  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  20.53 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  19.74 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2556  hypothetical protein  22.78 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  27.62 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  20 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  19.64 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  20.79 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3523  Fimbrial assembly family protein  25.13 
 
 		 489 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.54 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  23.62 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  18.31 
 
 		 353 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  21.12 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0539  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.14 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  20.85 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  20 
 
 		 359 aa  52.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  23.03 
 
 		 350 aa  52.8  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  19.71 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  20.74 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  22.97 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  19.68 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  21.97 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  19.37 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  20 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  19.69 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  19.37 
 
 		 359 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  21.3 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1875  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.52 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2701  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.12 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.942967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0758  general secretion pathway protein L  28.57 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0966219  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  19.85 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  19.05 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0953  type IV pilus assembly protein PilM  21.61 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3285  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.6 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  19.19 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  19.05 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  19.05 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  22.64 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3549  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.86 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1521  Fimbrial assembly family protein  27.37 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0573904  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  20.99 
 
 		 380 aa  46.2  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  18.84 
 
 		 374 aa  46.2  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1863  putative type IV pilus assembly protein PilM  20 
 
 		 309 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.455179 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1121  general secretion pathway protein l, putative  29.7 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4610  hypothetical protein  24.16 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  26.28 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  17.2 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>