80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4610 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4610  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3971  hypothetical protein  54.48 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179616  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0220  hypothetical protein  54.48 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3732  hypothetical protein  53.79 
 
 		 298 aa  291  7e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.97054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3888  hypothetical protein  48.76 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0333  hypothetical protein  45.74 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4066  hypothetical protein  45.74 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0255  hypothetical protein  51.38 
 
 		 292 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3691  HofM protein  29.45 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3764  HofM protein  29.09 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3808  hypothetical protein  28.62 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03247  predicted pilus assembly protein  28.78 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0614308  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3866  HofM protein  28.78 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0144518  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03199  hypothetical protein  28.78 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0635108  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3672  HofM protein  28.78 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000428263  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3590  HofM protein  28.06 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0186035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0318  hypothetical protein  28.06 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  0.101671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0318  conserved hypothetical protein  28.42 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.580292  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3772  HofM protein  27.7 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  24.53 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  23.25 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.84 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  21.91 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  21.91 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.84 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  21.91 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  23.84 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.91 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  21.91 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  21.91 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  21.91 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  21.35 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.47 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  21.35 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  21.35 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  21.91 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.89 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  21.02 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  21.91 
 
 		 359 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  25.29 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  25.88 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  25.29 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  26.51 
 
 		 354 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  23.81 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0893  hypothetical protein  26.18 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  20.12 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  27.01 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.16 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  25.29 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  24.1 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  19.66 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  26.44 
 
 		 348 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  30.41 
 
 		 383 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  23.64 
 
 		 354 aa  49.7  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  23.39 
 
 		 355 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  23.49 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  21.21 
 
 		 350 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  21.21 
 
 		 350 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1925  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.06 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  20.61 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2556  hypothetical protein  23.33 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  20.12 
 
 		 369 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  20.12 
 
 		 369 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0733  Fimbrial assembly family protein  21.08 
 
 		 571 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  19.05 
 
 		 351 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  23.53 
 
 		 359 aa  45.8  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  24.16 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  18.52 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  20 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  21.69 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  24.71 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  21.21 
 
 		 352 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  24.85 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  27.72 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  21.56 
 
 		 352 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  23.98 
 
 		 358 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  23.53 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  21.64 
 
 		 356 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>