82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3732 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3732  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.97054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3971  hypothetical protein  98.99 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179616  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0220  hypothetical protein  98.99 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4610  hypothetical protein  52.08 
 
 		 280 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3888  hypothetical protein  44.9 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0333  hypothetical protein  44.95 
 
 		 283 aa  241  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4066  hypothetical protein  44.71 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0255  hypothetical protein  46.18 
 
 		 292 aa  222  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3808  hypothetical protein  34.75 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3691  HofM protein  25.61 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3764  HofM protein  25.26 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  28.34 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0318  conserved hypothetical protein  26.24 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.580292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3672  HofM protein  24.83 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000428263  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3772  HofM protein  26.24 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3866  HofM protein  26.24 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0144518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03247  predicted pilus assembly protein  26.24 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0614308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03199  hypothetical protein  26.24 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0635108  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0318  hypothetical protein  25.61 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3590  HofM protein  25.61 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0186035  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  27.22 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  28.07 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  27.49 
 
 		 359 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  24.4 
 
 		 380 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  25.3 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  23.17 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  24.85 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  24.85 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  25.44 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  25.3 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4956  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.56 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  26.54 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 379 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  22.35 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  23.16 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  26.32 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  22.35 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  22.03 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  22.35 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  20.93 
 
 		 352 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  23.03 
 
 		 359 aa  52.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.79 
 
 		 359 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  22.89 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  22.89 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  20.34 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  23.78 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  24.1 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  26.26 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  20.34 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3272  type IV pilus assembly protein PilM  27.71 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  22.09 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  20.34 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.08 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  19.9 
 
 		 352 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5083  type IV pili biogenesis protein PilM, putative  25.14 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  19.77 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  21.79 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  20.34 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  23.35 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  27.06 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  24.85 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  19.65 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  20.9 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  21.2 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  20.35 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  23.35 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  24.53 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  21.74 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  23.78 
 
 		 372 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0539  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.39 
 
 		 353 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  19.28 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  25.85 
 
 		 361 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  25.6 
 
 		 361 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  28.57 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3135  Type IV pilus assembly protein PilM  25.9 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0733  Fimbrial assembly family protein  22.43 
 
 		 571 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  27.21 
 
 		 379 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.21 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  20.96 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  24.84 
 
 		 362 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  20 
 
 		 354 aa  42.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1140  Tfp pilus assembly protein ATPase  24.68 
 
 		 485 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0194747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>