85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0733 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0733  Fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 571 aa  1166    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  29.63 
 
 		 352 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  25.42 
 
 		 351 aa  90.9  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  29.63 
 
 		 352 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  27.89 
 
 		 354 aa  88.6  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  27.08 
 
 		 350 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  28.7 
 
 		 352 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  27.08 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  27.91 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  25.84 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  28.41 
 
 		 351 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  23.94 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  25.58 
 
 		 352 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  24.52 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  24.12 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  27.31 
 
 		 356 aa  72  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  27.31 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  26 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  23.27 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  25.17 
 
 		 350 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  23.63 
 
 		 359 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  22.7 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  23.5 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  26.76 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  25.62 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  25 
 
 		 358 aa  63.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  27.09 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  23.74 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  23.14 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  24.58 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  23.71 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.57 
 
 		 354 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  24.42 
 
 		 352 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.71 
 
 		 359 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.57 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  21.56 
 
 		 347 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  24.88 
 
 		 361 aa  59.7  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  23.71 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  23.71 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  23.9 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  25.29 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  24 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  23.43 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  23.43 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  24 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  21.95 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  24.29 
 
 		 359 aa  57  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  20.48 
 
 		 380 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  24 
 
 		 359 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  20.88 
 
 		 372 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  24.41 
 
 		 369 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  24.41 
 
 		 369 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.57 
 
 		 359 aa  54.7  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  23.14 
 
 		 359 aa  53.9  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  23.21 
 
 		 359 aa  53.5  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1726  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.6 
 
 		 323 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.221742  normal  0.0452005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  22.86 
 
 		 359 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  23.21 
 
 		 354 aa  50.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  21.56 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  23.43 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  22.97 
 
 		 348 aa  49.7  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  23.33 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  21.53 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  29.11 
 
 		 352 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  22.65 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  25.81 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1677  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  20.66 
 
 		 316 aa  48.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  22.9 
 
 		 354 aa  47.4  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0543  fimbrial assembly family protein  26.53 
 
 		 190 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  24.88 
 
 		 362 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5131  type IV pilus biogenesis protein PilN  20.61 
 
 		 208 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0220  hypothetical protein  22.9 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4610  hypothetical protein  21.08 
 
 		 280 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3971  hypothetical protein  22.9 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179616  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  24.86 
 
 		 356 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  23.86 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.72 
 
 		 331 aa  45.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4956  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.96 
 
 		 293 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1514  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  25.22 
 
 		 319 aa  45.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.87892  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  23.39 
 
 		 361 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3732  hypothetical protein  22.43 
 
 		 298 aa  45.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.97054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2690  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 187 aa  44.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000151344  hitchhiker  0.0026415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  23.39 
 
 		 361 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0404  fimbrial assembly  20.6 
 
 		 191 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  22.43 
 
 		 365 aa  43.9  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>