34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0333 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0333  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0255  hypothetical protein  65.4 
 
 		 292 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4066  hypothetical protein  51.77 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3888  hypothetical protein  53.9 
 
 		 283 aa  308  9e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0220  hypothetical protein  45.3 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3971  hypothetical protein  45.3 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3732  hypothetical protein  44.95 
 
 		 298 aa  241  7.999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.97054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4610  hypothetical protein  44.19 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3691  HofM protein  33.45 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3764  HofM protein  33.1 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3808  hypothetical protein  32.3 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0318  conserved hypothetical protein  30.88 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.580292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03247  predicted pilus assembly protein  30.53 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0614308  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3866  HofM protein  30.53 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0144518  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03199  hypothetical protein  30.53 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0635108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3590  HofM protein  31.23 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0186035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0318  hypothetical protein  31.23 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3672  HofM protein  30.88 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000428263  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3772  HofM protein  30.18 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  23.49 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  25.6 
 
 		 380 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 361 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 359 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.26 
 
 		 352 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.26 
 
 		 352 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  23.26 
 
 		 352 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  22.99 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  23.17 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  20.83 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  23.7 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4956  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  26.8 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  20.48 
 
 		 350 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5083  type IV pili biogenesis protein PilM, putative  26.29 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  20.61 
 
 		 351 aa  42  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>