66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0255 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0255  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  589  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0333  hypothetical protein  65.4 
 
 		 283 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3888  hypothetical protein  58.82 
 
 		 283 aa  334  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4066  hypothetical protein  56.55 
 
 		 283 aa  333  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0220  hypothetical protein  46.08 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3971  hypothetical protein  46.08 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3732  hypothetical protein  45.73 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.97054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4610  hypothetical protein  49.81 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3691  HofM protein  30.8 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3764  HofM protein  30.45 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3808  hypothetical protein  32.17 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03247  predicted pilus assembly protein  27.18 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0614308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03199  hypothetical protein  27.18 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0635108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3866  HofM protein  27.18 
 
 		 259 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0144518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0318  conserved hypothetical protein  27.18 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.580292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3672  HofM protein  27.18 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000428263  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0318  hypothetical protein  28.82 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3590  HofM protein  28.82 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0186035  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3772  HofM protein  27.18 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  21.95 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  30.22 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.03 
 
 		 380 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  23.89 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  28.24 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0893  hypothetical protein  29.82 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  24.56 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 359 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  22.56 
 
 		 359 aa  52.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  26.94 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  21.51 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  21.51 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  23.17 
 
 		 359 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.95 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  22.56 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  21.34 
 
 		 359 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  27.87 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  26.35 
 
 		 354 aa  49.7  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  21.34 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  21.39 
 
 		 352 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  21.34 
 
 		 359 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  21.34 
 
 		 359 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  21.34 
 
 		 359 aa  49.3  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  20.35 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  25.27 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  21.18 
 
 		 351 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.71 
 
 		 352 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  20.71 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  23.98 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1925  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  23.81 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  28.65 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  28.74 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  23.98 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  20.12 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  28 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  19.88 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  20.48 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  22.81 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  20.93 
 
 		 350 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  20.96 
 
 		 367 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  22.81 
 
 		 356 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2556  hypothetical protein  24.57 
 
 		 317 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  18.82 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>