84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0893 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0893  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2556  hypothetical protein  63.38 
 
 		 317 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0307  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  28.91 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  26.67 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  22.03 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  21.68 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  21.38 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  21.02 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  31.11 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  24.3 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  28.86 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  28.86 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  22.35 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  21.51 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  20.7 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  27.78 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  27.8 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  27.37 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  24.77 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  27.07 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.29 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  24.03 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.02 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  22.96 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  28.65 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  20.36 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.33 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  26.61 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  22.18 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  25.54 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.33 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  21.84 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  29.05 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  27.07 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  28.36 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2565  type IV pilus assembly protein PilM  21.45 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  20.73 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  23.94 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  23.36 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  21.31 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  21.98 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  25.41 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  22.04 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1170  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  21.41 
 
 		 485 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00808217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0953  type IV pilus assembly protein PilM  27.32 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0255  hypothetical protein  29.82 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1339  type IV pilus assembly protein PilM  25.45 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  22.27 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  25.62 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  23.21 
 
 		 355 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4610  hypothetical protein  26.18 
 
 		 280 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1358  type IV pilus assembly family protein  22.5 
 
 		 485 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.590178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  20.74 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1140  Tfp pilus assembly protein ATPase  22.92 
 
 		 485 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0194747  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  23.78 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0047  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  29.84 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  20.97 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  22.42 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  27.54 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002322  type IV pilus biogenesis protein PilM  20.96 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.17332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  25.98 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  25.2 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1726  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.51 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.221742  normal  0.0452005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  24.41 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2100  type IV pilus assembly protein PilM  21.4 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  26.77 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.3 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  20.5 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  25.58 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  23 
 
 		 374 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  25.98 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  27.43 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  24.12 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  22.12 
 
 		 358 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  22.62 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  22.75 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3888  hypothetical protein  27.27 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1782  hypothetical protein  22.77 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0893259  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  24.34 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  21.79 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  24.41 
 
 		 359 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  22.83 
 
 		 359 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  24.24 
 
 		 352 aa  42.4  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>