136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1605 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 365 aa  724    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  54.52 
 
 		 369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  54.52 
 
 		 369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  54.5 
 
 		 374 aa  403  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  52.97 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  48.34 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  50.85 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  43.99 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  26.16 
 
 		 351 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  26.17 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  25.34 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.85 
 
 		 354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  26.72 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  25.2 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  24.85 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  24.05 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  24.09 
 
 		 350 aa  110  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  24.24 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  23.28 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.71 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  23.27 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  25.31 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  22.97 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.6 
 
 		 352 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  23.38 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  25.79 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  24.59 
 
 		 353 aa  95.9  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  23.5 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  23.29 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  21.94 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  22.4 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  28.98 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  22.09 
 
 		 352 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  24.8 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  20.82 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  22.92 
 
 		 362 aa  86.7  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  23.08 
 
 		 360 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  21.68 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  23.01 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  22.79 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  22.79 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  21.82 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  23.33 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.31 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.31 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3253  type IV pilus assembly protein PilM  22.12 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  21.68 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  22.07 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  21.1 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  22.73 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  23.45 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  23.25 
 
 		 354 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0184  type IV pilus assembly protein PilM  25.07 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  21.9 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.33 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  20.67 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  21.61 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  21.61 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  21.69 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.4 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  23.4 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  20.92 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  24.14 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  21.43 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.61 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.16 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  21.43 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  21.43 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  21.33 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  20.17 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  21.04 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  21.33 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2211  putative fimbrial assembly protein PilM  22.22 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0494423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  23.51 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  22.88 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  23.35 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  23.66 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  21.52 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  21.67 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  20.56 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  21.81 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  20.74 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  25.82 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  21.97 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1358  type IV pilus assembly family protein  26.98 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.590178  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1140  Tfp pilus assembly protein ATPase  26.2 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0194747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0656  type IV pilus assembly protein PilM  20.16 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000003661  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1170  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  25.4 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00808217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  20.82 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  18.36 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  29.08 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  21.8 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  23.58 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  20.8 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  21.19 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  21.96 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  19.88 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1101  cell division protein FtsA  23.15 
 
 		 594 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0628418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>