19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0318 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0318  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3590  HofM protein  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0186035  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0318  conserved hypothetical protein  96.91 
 
 		 259 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.580292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3866  HofM protein  96.14 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0144518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03247  predicted pilus assembly protein  96.14 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0614308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3672  HofM protein  96.12 
 
 		 259 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000428263  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3772  HofM protein  96.53 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03199  hypothetical protein  96.14 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0635108  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3691  HofM protein  65.76 
 
 		 259 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3764  HofM protein  64.98 
 
 		 259 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3808  hypothetical protein  47.66 
 
 		 260 aa  252  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0333  hypothetical protein  31.23 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4066  hypothetical protein  29.39 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3888  hypothetical protein  30.25 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0255  hypothetical protein  28.74 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4610  hypothetical protein  26.64 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3971  hypothetical protein  26.24 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3732  hypothetical protein  25.61 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.97054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0220  hypothetical protein  26.24 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>