58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1925 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1925  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  100 
 
 		 308 aa  630  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1280  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  54.84 
 
 		 305 aa  347  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3003  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  53.25 
 
 		 305 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1863  putative type IV pilus assembly protein PilM  54.18 
 
 		 309 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.455179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1782  hypothetical protein  46.1 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0893259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2419  putative type IV pilus assembly protein PilM  42.67 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1466  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  31.58 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1683  hypothetical protein  27.36 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0132  hypothetical protein  22.36 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  26.27 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  25.94 
 
 		 350 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  22.78 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  24.47 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1577  hypothetical protein  24.87 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  25.52 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.93 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  23.55 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  25.55 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  21.85 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  21.85 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  23.14 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  26.05 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  22.94 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  22.22 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  24.53 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  23.72 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  23.81 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  23.87 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  22.51 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  23.96 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  21.68 
 
 		 369 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  21.68 
 
 		 369 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  23.18 
 
 		 368 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  22.27 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  20.86 
 
 		 392 aa  52.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.27 
 
 		 354 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.16 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  25.27 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  18.94 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  22.38 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0184  type IV pilus assembly protein PilM  23.12 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  20.81 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  22.65 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  23.23 
 
 		 379 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  22.09 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  23.19 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0975  type IV pilus assembly protein PilM  27.78 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  22.41 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4610  hypothetical protein  24.06 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  22.59 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0255  hypothetical protein  23.81 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  23.38 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5083  type IV pili biogenesis protein PilM, putative  21.89 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  22.57 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  23.73 
 
 		 383 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  21.85 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  23.7 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1991  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  22.05 
 
 		 621 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>