36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2419 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2419  putative type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 315 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1280  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  46.45 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1925  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  42.67 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3003  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  45.6 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1782  hypothetical protein  43 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0893259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1863  putative type IV pilus assembly protein PilM  43.07 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.455179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1466  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  33.98 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0132  hypothetical protein  25.13 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1683  hypothetical protein  27.27 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  24.54 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1577  hypothetical protein  29.6 
 
 		 546 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  23.72 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  24.43 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.79 
 
 		 351 aa  52.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  25.88 
 
 		 351 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  23.44 
 
 		 379 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  23.08 
 
 		 352 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  25.64 
 
 		 351 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  22.33 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  23.5 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  23.5 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  24.11 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  26.39 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  32.38 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  32.38 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  26.85 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  22.07 
 
 		 351 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  24.56 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  24.56 
 
 		 352 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  22.22 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  24.3 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  23.85 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  22.37 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  21.59 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  22.83 
 
 		 392 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  20.6 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>