31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1466 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1466  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  100 
 
 		 306 aa  607  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1925  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  32.24 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1280  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  34.52 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1782  hypothetical protein  32.46 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0893259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3003  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  32.46 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2419  putative type IV pilus assembly protein PilM  35.16 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1863  putative type IV pilus assembly protein PilM  32.12 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.455179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0132  hypothetical protein  31.43 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1683  hypothetical protein  30.59 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  25.47 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  24.57 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  20.63 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  21.12 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1577  hypothetical protein  25.62 
 
 		 546 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  21.6 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  22.91 
 
 		 392 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  23.38 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  23.95 
 
 		 352 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  21.71 
 
 		 354 aa  46.2  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  28.9 
 
 		 282 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5133  type IV pili biogenesis protein PilM  26.34 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  22.17 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5083  type IV pili biogenesis protein PilM, putative  23.53 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4956  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  24.77 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.08 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  17.28 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  21.64 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  20.74 
 
 		 354 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  20.74 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>