43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1863 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1863  putative type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 309 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.455179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1782  hypothetical protein  57.28 
 
 		 307 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0893259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1925  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  53.07 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1280  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  49.19 
 
 		 305 aa  299  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3003  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  48.87 
 
 		 305 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2419  putative type IV pilus assembly protein PilM  41.56 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1466  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  31.39 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0132  hypothetical protein  29.06 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1683  hypothetical protein  23.92 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1577  hypothetical protein  26.18 
 
 		 546 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  23.2 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  23.76 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  23.98 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  23.43 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  25 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  22.91 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  23.43 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  20.35 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  21.2 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  21.55 
 
 		 351 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1131  type IV pilus assembly protein PilM  25.67 
 
 		 383 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  22.95 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2686  type IV pilus assembly protein PilM  27.59 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000584895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  19.85 
 
 		 352 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  24.55 
 
 		 359 aa  49.7  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  19.82 
 
 		 352 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  20.67 
 
 		 352 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  20.79 
 
 		 350 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3019  type IV pilus assembly protein PilM  27.27 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  20.99 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1336  type IV pilus assembly protein PilM  22.94 
 
 		 379 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  0.906324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  23.89 
 
 		 354 aa  46.2  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1031  hypothetical protein  20 
 
 		 329 aa  45.8  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.19804  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0998  type IV pilus assembly protein PilM  22.54 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2701  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  27.59 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.942967 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00033  fimbrial assembly protein PilM  24.16 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  21.13 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  21.13 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  19.32 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1029  type IV pilus assembly protein PilM  23.44 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  23.39 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3288  type IV pilus assembly protein PilM  22.27 
 
 		 368 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1718  type IV pilus assembly protein PilM  26.42 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>