More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0178 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2949  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  44.09 
 
 		 1148 aa  734    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1532  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  51.25 
 
 		 1126 aa  668    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0414  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.97 
 
 		 1115 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0178041  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0603  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.56 
 
 		 1272 aa  736    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0804  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.83 
 
 		 1228 aa  721    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0442499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  43.44 
 
 		 1240 aa  753    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4338  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  45.95 
 
 		 1160 aa  808    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0183  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.8 
 
 		 1183 aa  722    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0702536  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0965  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.8 
 
 		 1187 aa  796    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.59 
 
 		 1177 aa  717    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.907147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0160  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.91 
 
 		 1191 aa  702    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0446  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  40.63 
 
 		 1235 aa  794    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0123  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.46 
 
 		 1177 aa  714    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.92 
 
 		 1145 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000841151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.59 
 
 		 1177 aa  717    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.59 
 
 		 1177 aa  717    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.42 
 
 		 1284 aa  772    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0096  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.59 
 
 		 1177 aa  717    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3933  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.28 
 
 		 1143 aa  806    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.854688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.85 
 
 		 1177 aa  719    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16761  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.53 
 
 		 1097 aa  790    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0391  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  44.57 
 
 		 1181 aa  802    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2654  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.27 
 
 		 1155 aa  820    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679256  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.41 
 
 		 1095 aa  785    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0988562  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1778  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.06 
 
 		 1103 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.21 
 
 		 1117 aa  816    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0278  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.1 
 
 		 1227 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00054451  hitchhiker  0.000191986 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18861  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.3 
 
 		 1095 aa  785    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.816976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0579  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.98 
 
 		 1183 aa  718    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1751  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.06 
 
 		 1103 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0917  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.89 
 
 		 1158 aa  791    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf212  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  43.81 
 
 		 1197 aa  647    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1962  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.31 
 
 		 1301 aa  676    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.768715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1108  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  42.98 
 
 		 1279 aa  726    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.10244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2719  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  45.3 
 
 		 1176 aa  685    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2067  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.85 
 
 		 1097 aa  774    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.883429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19910  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45 
 
 		 1185 aa  803    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.168959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.59 
 
 		 1183 aa  712    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.59 
 
 		 1177 aa  717    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.85 
 
 		 1097 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.702205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1522  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.4 
 
 		 1100 aa  795    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0070  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.81 
 
 		 1287 aa  771    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5203  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.46 
 
 		 1177 aa  714    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000890566  unclonable  1.148e-23 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.11 
 
 		 1141 aa  803    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2697  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.54 
 
 		 1169 aa  798    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.275742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0974  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  51.24 
 
 		 1070 aa  671    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000799261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0573  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.79 
 
 		 1141 aa  799    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3155  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.49 
 
 		 1169 aa  812    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.268483 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.07 
 
 		 1183 aa  771    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.846031  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0178  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  100 
 
 		 1434 aa  2918    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0859  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.83 
 
 		 1238 aa  856    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111826  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16651  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.19 
 
 		 1097 aa  786    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.06 
 
 		 1185 aa  711    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000686573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0488  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.59 
 
 		 1099 aa  804    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.97 
 
 		 1246 aa  692    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17250  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.36 
 
 		 1168 aa  789    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0680  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.49 
 
 		 1171 aa  801    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1138  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  45.53 
 
 		 1168 aa  797    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0636  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.83 
 
 		 1152 aa  751    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01090  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  50.55 
 
 		 1090 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000929297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0741  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.07 
 
 		 1096 aa  816    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29830  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.16 
 
 		 1170 aa  800    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0969  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.27 
 
 		 1166 aa  802    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.96 
 
 		 1122 aa  810    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6627  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.58 
 
 		 1160 aa  791    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.11 
 
 		 1149 aa  805    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613328  normal  0.794281 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2722  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  43.65 
 
 		 1234 aa  831    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2408  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  43.65 
 
 		 1234 aa  831    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154863  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4325  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.94 
 
 		 1143 aa  806    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.0767673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2939  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.55 
 
 		 1102 aa  806    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6057  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.13 
 
 		 1141 aa  802    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16071  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.62 
 
 		 1096 aa  774    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.614693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3687  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  45.47 
 
 		 1278 aa  683    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0186  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  44.38 
 
 		 1174 aa  683    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2341  DNA-directed RNA polymerase  48.99 
 
 		 1107 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03800  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.54 
 
 		 1170 aa  793    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0997  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.27 
 
 		 1172 aa  802    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1981  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.47 
 
 		 1196 aa  858    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1375  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit  45.15 
 
 		 1197 aa  678    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.53 
 
 		 1212 aa  681    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140323 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1825  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.91 
 
 		 1202 aa  823    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1845  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.17 
 
 		 1193 aa  706    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2984  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.36 
 
 		 1171 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.816436  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.6 
 
 		 1174 aa  805    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0605321 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23930  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.16 
 
 		 1162 aa  783    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0114  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.59 
 
 		 1130 aa  717    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.65239e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0133  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.59 
 
 		 1177 aa  717    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000446144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.32 
 
 		 1169 aa  818    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.289387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0580  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.84 
 
 		 1170 aa  797    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0311917 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1170  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  44.8 
 
 		 1171 aa  751    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0809825  unclonable  0.000000172992 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20950  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.27 
 
 		 1161 aa  810    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.81555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0711  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.04 
 
 		 1166 aa  806    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2724  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  44.87 
 
 		 1250 aa  871    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.280863  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0987  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.27 
 
 		 1172 aa  801    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1257  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.27 
 
 		 1161 aa  800    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568598 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.17 
 
 		 1202 aa  699    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04361  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.07 
 
 		 1097 aa  776    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10681  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.6 
 
 		 1178 aa  797    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0099  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.12 
 
 		 1190 aa  879    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0620  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  44.89 
 
 		 1165 aa  800    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>