More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3591 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3591  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 465 aa  888    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3002  amino acid permease-associated region  53.78 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.993611  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2299  amino acid permease-associated region  54.36 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02211  amino acid transporter  48.2 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2563  amino acid permease-associated region  51.29 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.239027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0972  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 470 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2583  GABA permease  44.62 
 
 		 463 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0522  GABA permease  44.62 
 
 		 463 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1078  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 469 aa  356  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0426  GABA permease  44.4 
 
 		 463 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0452  GABA permease  44.87 
 
 		 463 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131648  normal  0.0220043 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0494  GABA permease  44.62 
 
 		 463 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3609  GABA transporter  44.4 
 
 		 463 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3893  amino acid permease-associated region  44.44 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.375275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22390  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  49.21 
 
 		 457 aa  349  7e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2876  GABA permease  44.99 
 
 		 463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975083  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2921  GABA permease  42.42 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4909  GABA permease  41.76 
 
 		 463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4133  amino acid permease-associated region  46.89 
 
 		 472 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3570  amino acid permease-associated region  45 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5356  gamma-aminobutyrate permease  41.32 
 
 		 463 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0956  GABA permease  44.29 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1926  GABA permease  44.29 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.620655  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0660  GABA permease  44.29 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3572  GABA permease  44.29 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3600  GABA permease  44.5 
 
 		 587 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3590  GABA permease  44.29 
 
 		 541 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.566491  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3325  amino acid permease-associated region  52.15 
 
 		 471 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0515  GABA permease  44.06 
 
 		 467 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  43.92 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0284  GABA permease  41.94 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  hitchhiker  0.000157703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0302  GABA permease  41.94 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0307  GABA permease  41.72 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  40.04 
 
 		 464 aa  323  6e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3823  GABA permease  40.18 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  40.04 
 
 		 487 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  40.18 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1805  amino acid permease-associated region  44 
 
 		 469 aa  319  7.999999999999999e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607317  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3570  GABA permease  39.96 
 
 		 464 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3468  gamma-aminobutyrate permease  39.96 
 
 		 464 aa  316  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3482  gamma-aminobutyrate permease  39.96 
 
 		 464 aa  316  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3853  GABA permease  39.96 
 
 		 464 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.261193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2911  GABA permease  39.82 
 
 		 463 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2780  GABA permease  39.6 
 
 		 463 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4926  GABA permease  41.72 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2872  GABA permease  39.77 
 
 		 463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1107  amino acid permease-associated region  45.66 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.144574  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5379  amino acid permease-associated region  40.74 
 
 		 459 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0243202  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3459  amino acid permease-associated region  40.74 
 
 		 459 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4907  amino acid permease-associated region  40.74 
 
 		 459 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0786  amino acid tranporter  41.03 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1447  amino acid permease-associated region  38.93 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10533  gaba permease gabP (4-amino butyrate transport carrier)  45.6 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4407  amino acid ABC transporter permease  39.38 
 
 		 460 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0417319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2938  gamma-aminobutyrate transporter  40.38 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.111546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02519  gamma-aminobutyrate transporter  39.72 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1020  GABA permease  39.72 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3905  gamma-aminobutyrate transporter  39.72 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.667666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2783  gamma-aminobutyrate transporter  39.72 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.414998 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2798  gamma-aminobutyrate transporter  39.72 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02483  hypothetical protein  39.72 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2973  gamma-aminobutyrate transporter  40.38 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  0.0482196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0313  GABA permease  41.03 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3095  gamma-aminobutyrate transporter  40.38 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3218  gamma-aminobutyrate transporter  39.72 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2990  gamma-aminobutyrate transporter  40.38 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2906  gamma-aminobutyrate transporter  40.38 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1043  gamma-aminobutyrate transporter  39.72 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2943  gamma-aminobutyrate transporter  39.72 
 
 		 466 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1479  GABA permease  41.61 
 
 		 449 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10983  hitchhiker  0.00182133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1998  amino acid permease-associated region  42.56 
 
 		 608 aa  299  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.89102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4114  GABA permease  39.19 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  39.9 
 
 		 462 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0122  amino acid permease-associated region  43.09 
 
 		 606 aa  295  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2616  amino acid permease-associated region  38.84 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923502  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4765  amino acid permease-associated region  39.56 
 
 		 463 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3382  amino acid permease-associated region  40.49 
 
 		 606 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3371  amino acid permease-associated region  40.49 
 
 		 606 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3433  amino acid permease-associated region  40.49 
 
 		 606 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3380  amino acid permease-associated region  39.65 
 
 		 460 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0906  amino acid permease-associated region  40.09 
 
 		 468 aa  293  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4627  amino acid permease-associated region  39.34 
 
 		 463 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0667  amino acid permease-associated region  39.08 
 
 		 464 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.450649  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1758  amino acid permease-associated region  39.87 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3679  amino acid permease-associated region  40.13 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.720671  hitchhiker  0.00000622895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4106  amino acid ABC transporter permease  39.87 
 
 		 460 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4756  amino acid permease  39.12 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000433889  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  37.53 
 
 		 466 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2293  GABA permease  40.22 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3973  amino acid permease-associated region  39.07 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2188  amino acid permease-associated region  41.2 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000662916  hitchhiker  0.000260404 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  38.23 
 
 		 464 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3276  GABA permease  41.67 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  36.78 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  35.65 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1513  gamma-aminobutyrate permease  38.94 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  37.89 
 
 		 466 aa  280  3e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1887  amino acid permease-associated region  34.92 
 
 		 466 aa  279  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  35.82 
 
 		 470 aa  279  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  36.19 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>