More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1078 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1078  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 469 aa  896    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0972  amino acid permease-associated region  91.91 
 
 		 470 aa  768    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2563  amino acid permease-associated region  69.43 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.239027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2299  amino acid permease-associated region  70.47 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3002  amino acid permease-associated region  66.37 
 
 		 455 aa  539  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.993611  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02211  amino acid transporter  66.59 
 
 		 462 aa  533  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22390  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  49.66 
 
 		 457 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3591  amino acid permease-associated region  50.22 
 
 		 465 aa  361  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251837  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3325  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 471 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2921  GABA permease  43.74 
 
 		 463 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3590  GABA permease  43.44 
 
 		 541 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.566491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3600  GABA permease  43.44 
 
 		 587 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18864  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1926  GABA permease  43.7 
 
 		 467 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.620655  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0660  GABA permease  43.7 
 
 		 467 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0956  GABA permease  43.7 
 
 		 467 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3572  GABA permease  43.7 
 
 		 467 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0515  GABA permease  43.7 
 
 		 467 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2876  GABA permease  43.11 
 
 		 463 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975083  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3609  GABA transporter  42.79 
 
 		 463 aa  339  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0494  GABA permease  42.57 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2583  GABA permease  42.57 
 
 		 463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0522  GABA permease  42.57 
 
 		 463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829612  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0426  GABA permease  42.63 
 
 		 463 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  46.73 
 
 		 465 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0452  GABA permease  42.57 
 
 		 463 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131648  normal  0.0220043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  40.94 
 
 		 487 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3823  GABA permease  41.09 
 
 		 464 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5356  gamma-aminobutyrate permease  41.3 
 
 		 463 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  41.09 
 
 		 464 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3893  amino acid permease-associated region  46.12 
 
 		 472 aa  332  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.375275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3570  GABA permease  41.3 
 
 		 464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3468  gamma-aminobutyrate permease  41.3 
 
 		 464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3482  gamma-aminobutyrate permease  41.3 
 
 		 464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  41.09 
 
 		 464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3853  GABA permease  41.3 
 
 		 464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.261193  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4627  amino acid permease-associated region  44.57 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0284  GABA permease  42.44 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  hitchhiker  0.000157703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0307  GABA permease  42.44 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4909  GABA permease  41.72 
 
 		 463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0302  GABA permease  42.44 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4765  amino acid permease-associated region  44.34 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4756  amino acid permease  44.34 
 
 		 463 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000433889  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4133  amino acid permease-associated region  45.71 
 
 		 472 aa  325  9e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1805  amino acid permease-associated region  46.84 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607317  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0667  amino acid permease-associated region  43.36 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.450649  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2293  GABA permease  43.02 
 
 		 468 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4926  GABA permease  42 
 
 		 461 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1479  GABA permease  41.16 
 
 		 449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10983  hitchhiker  0.00182133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2911  GABA permease  40.09 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2780  GABA permease  39.87 
 
 		 463 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2938  gamma-aminobutyrate transporter  41.94 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.111546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3095  gamma-aminobutyrate transporter  41.69 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2973  gamma-aminobutyrate transporter  41.69 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  0.0482196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2906  gamma-aminobutyrate transporter  41.69 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2943  gamma-aminobutyrate transporter  39.59 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2990  gamma-aminobutyrate transporter  41.69 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2783  gamma-aminobutyrate transporter  39.36 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.414998 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1020  GABA permease  39.36 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2872  GABA permease  40.45 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3218  gamma-aminobutyrate transporter  41.09 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1043  gamma-aminobutyrate transporter  39.36 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2798  gamma-aminobutyrate transporter  39.36 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02519  gamma-aminobutyrate transporter  39.36 
 
 		 466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02483  hypothetical protein  39.36 
 
 		 466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3905  gamma-aminobutyrate transporter  39.36 
 
 		 466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.667666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1758  amino acid permease-associated region  40.48 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4106  amino acid ABC transporter permease  40.83 
 
 		 460 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3380  amino acid permease-associated region  40.78 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3570  amino acid permease-associated region  42.42 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3679  amino acid permease-associated region  41.35 
 
 		 460 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.720671  hitchhiker  0.00000622895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2021  amino acid permease-associated region  41.24 
 
 		 480 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1107  amino acid permease-associated region  43.42 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.144574  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4114  GABA permease  43.28 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0313  GABA permease  40.97 
 
 		 463 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3276  GABA permease  41.83 
 
 		 461 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0906  amino acid permease-associated region  40.5 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3753  amino acid permease-associated region  38.98 
 
 		 478 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109507  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6223  amino acid permease-associated region  39.32 
 
 		 481 aa  289  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4407  amino acid ABC transporter permease  35.95 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0417319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2214  amino acid permease-associated region  39.69 
 
 		 469 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2188  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 491 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000662916  hitchhiker  0.000260404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2038  amino acid permease-associated region  39.6 
 
 		 470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4364  amino acid permease-associated region  40.64 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1447  amino acid permease-associated region  36.3 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0686  beta-alanine/gamma-aminobutyrate-H+ symporter  40.23 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3171  amino acid permease-associated region  40.18 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.12607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2543  amino acid ABC transporter permease  40.18 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0431573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  35.63 
 
 		 468 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01580  gamma-aminobutyrate permease  40.97 
 
 		 475 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683743  normal  0.83882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0205  gamma-aminobutyrate permease  40.75 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  38.16 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10533  gaba permease gabP (4-amino butyrate transport carrier)  41.78 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  35.41 
 
 		 468 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  35.41 
 
 		 468 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3734  GABA permease  49.67 
 
 		 309 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9528e-18 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  38.57 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  38.63 
 
 		 461 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  39.76 
 
 		 447 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  39.76 
 
 		 447 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  39.76 
 
 		 447 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>