More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2299 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2299  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 459 aa  879    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2563  amino acid permease-associated region  80.92 
 
 		 461 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.239027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3002  amino acid permease-associated region  70.62 
 
 		 455 aa  581  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.993611  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0972  amino acid permease-associated region  72.81 
 
 		 470 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1078  amino acid permease-associated region  70.47 
 
 		 469 aa  550  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02211  amino acid transporter  67.72 
 
 		 462 aa  546  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3591  amino acid permease-associated region  54.36 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22390  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  51.45 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3325  amino acid permease-associated region  54.57 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3893  amino acid permease-associated region  46.29 
 
 		 472 aa  345  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.375275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4133  amino acid permease-associated region  47.39 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2876  GABA permease  43.76 
 
 		 463 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975083  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3609  GABA transporter  42.04 
 
 		 463 aa  336  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0426  GABA permease  42.63 
 
 		 463 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0452  GABA permease  42.41 
 
 		 463 aa  333  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131648  normal  0.0220043 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2583  GABA permease  41.96 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0522  GABA permease  41.96 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0494  GABA permease  41.96 
 
 		 463 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  44.91 
 
 		 465 aa  329  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0284  GABA permease  41.78 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  hitchhiker  0.000157703 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1926  GABA permease  42.82 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.620655  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0956  GABA permease  42.82 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0515  GABA permease  42.82 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3590  GABA permease  42.82 
 
 		 541 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.566491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3572  GABA permease  42.82 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0660  GABA permease  42.82 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0307  GABA permease  41.78 
 
 		 461 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0302  GABA permease  41.78 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3600  GABA permease  42.82 
 
 		 587 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4909  GABA permease  40.48 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5356  gamma-aminobutyrate permease  40.35 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2921  GABA permease  41.88 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84822  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0667  amino acid permease-associated region  42.95 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.450649  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3823  GABA permease  42.76 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1805  amino acid permease-associated region  43.89 
 
 		 469 aa  319  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607317  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  44.39 
 
 		 487 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4765  amino acid permease-associated region  44.04 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3570  GABA permease  44.14 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3468  gamma-aminobutyrate permease  44.14 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3482  gamma-aminobutyrate permease  44.14 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3853  GABA permease  44.14 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.261193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  44.14 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4627  amino acid permease-associated region  43.81 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  44.14 
 
 		 464 aa  316  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2911  GABA permease  39.69 
 
 		 463 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4756  amino acid permease  43.58 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000433889  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3276  GABA permease  43.88 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2780  GABA permease  39.47 
 
 		 463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4926  GABA permease  40.67 
 
 		 461 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1107  amino acid permease-associated region  46.8 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.144574  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3570  amino acid permease-associated region  42.39 
 
 		 460 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2872  GABA permease  40.14 
 
 		 463 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3218  gamma-aminobutyrate transporter  39.05 
 
 		 466 aa  303  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02519  gamma-aminobutyrate transporter  39.05 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1020  GABA permease  39.05 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1479  GABA permease  44.44 
 
 		 449 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10983  hitchhiker  0.00182133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3905  gamma-aminobutyrate transporter  39.05 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.667666 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1043  gamma-aminobutyrate transporter  39.05 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2798  gamma-aminobutyrate transporter  39.05 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02483  hypothetical protein  39.05 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2783  gamma-aminobutyrate transporter  39.05 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.414998 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2943  gamma-aminobutyrate transporter  39.05 
 
 		 466 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0313  GABA permease  39.96 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2293  GABA permease  40.76 
 
 		 468 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4114  GABA permease  42.42 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2938  gamma-aminobutyrate transporter  39.86 
 
 		 466 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.111546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2973  gamma-aminobutyrate transporter  39.63 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  0.0482196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2990  gamma-aminobutyrate transporter  39.63 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3095  gamma-aminobutyrate transporter  39.63 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2906  gamma-aminobutyrate transporter  39.63 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1447  amino acid permease-associated region  38.19 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2021  amino acid permease-associated region  40.42 
 
 		 480 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3380  amino acid permease-associated region  41.99 
 
 		 460 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5379  amino acid permease-associated region  40.31 
 
 		 459 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0243202  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3459  amino acid permease-associated region  40.56 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4907  amino acid permease-associated region  40.56 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3679  amino acid permease-associated region  41.59 
 
 		 460 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.720671  hitchhiker  0.00000622895 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3753  amino acid permease-associated region  40.18 
 
 		 478 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0122  amino acid permease-associated region  43.76 
 
 		 606 aa  292  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0906  amino acid permease-associated region  40.8 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1758  amino acid permease-associated region  39.38 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4106  amino acid ABC transporter permease  41.59 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0786  amino acid tranporter  37.22 
 
 		 459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4407  amino acid ABC transporter permease  37.73 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0417319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10533  gaba permease gabP (4-amino butyrate transport carrier)  44.59 
 
 		 434 aa  286  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1998  amino acid permease-associated region  43.49 
 
 		 608 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.89102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2038  amino acid permease-associated region  40.34 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2543  amino acid ABC transporter permease  40.1 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0431573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3171  amino acid permease-associated region  40.1 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.12607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3382  amino acid permease-associated region  42.52 
 
 		 606 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3371  amino acid permease-associated region  42.52 
 
 		 606 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3433  amino acid permease-associated region  42.52 
 
 		 606 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2214  amino acid permease-associated region  39.71 
 
 		 469 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0686  beta-alanine/gamma-aminobutyrate-H+ symporter  40 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3973  amino acid permease-associated region  38.28 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  39.95 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0205  gamma-aminobutyrate permease  41.42 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  39.95 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01580  gamma-aminobutyrate permease  40.94 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683743  normal  0.83882 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  39.95 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>