More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02211 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02211  amino acid transporter  100 
 
 
462 aa  877    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3002  amino acid permease-associated region  79.41 
 
 
455 aa  667    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.993611  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2563  amino acid permease-associated region  67.05 
 
 
461 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.239027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2299  amino acid permease-associated region  67.72 
 
 
459 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1078  amino acid permease-associated region  66.59 
 
 
469 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0972  amino acid permease-associated region  68.56 
 
 
470 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22390  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  49.22 
 
 
457 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3591  amino acid permease-associated region  48.82 
 
 
465 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251837  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3325  amino acid permease-associated region  52.39 
 
 
471 aa  354  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  44.93 
 
 
465 aa  348  9e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  42.47 
 
 
464 aa  339  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3823  GABA permease  42.96 
 
 
464 aa  338  8e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  42.73 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  42.26 
 
 
487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3570  GABA permease  41.22 
 
 
464 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3468  gamma-aminobutyrate permease  41.22 
 
 
464 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3482  gamma-aminobutyrate permease  41.22 
 
 
464 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3893  amino acid permease-associated region  44.17 
 
 
472 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.375275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3853  GABA permease  41.22 
 
 
464 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.261193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4133  amino acid permease-associated region  45.15 
 
 
472 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1479  GABA permease  43.55 
 
 
449 aa  326  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10983  hitchhiker  0.00182133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4627  amino acid permease-associated region  44.12 
 
 
463 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000229605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4765  amino acid permease-associated region  43.5 
 
 
463 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4756  amino acid permease  43.89 
 
 
463 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000433889  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1926  GABA permease  42.82 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.620655  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3572  GABA permease  42.82 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0956  GABA permease  42.82 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0660  GABA permease  42.82 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0515  GABA permease  42.82 
 
 
467 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3590  GABA permease  42.82 
 
 
541 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.566491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3679  amino acid permease-associated region  43.79 
 
 
460 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.720671  hitchhiker  0.00000622895 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3600  GABA permease  42.82 
 
 
587 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3380  amino acid permease-associated region  42.57 
 
 
460 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2921  GABA permease  41.82 
 
 
463 aa  316  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84822  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0667  amino acid permease-associated region  42.6 
 
 
464 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.450649  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1758  amino acid permease-associated region  43.15 
 
 
460 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4106  amino acid ABC transporter permease  43.34 
 
 
460 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3753  amino acid permease-associated region  43.54 
 
 
478 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3609  GABA transporter  41.82 
 
 
463 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1805  amino acid permease-associated region  46.17 
 
 
469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607317  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0906  amino acid permease-associated region  40.35 
 
 
468 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1107  amino acid permease-associated region  44.97 
 
 
453 aa  312  7.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.144574  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0426  GABA permease  41.36 
 
 
463 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2911  GABA permease  40 
 
 
463 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2583  GABA permease  41.36 
 
 
463 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0522  GABA permease  41.36 
 
 
463 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829612  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0452  GABA permease  41.36 
 
 
463 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131648  normal  0.0220043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4909  GABA permease  40.22 
 
 
463 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0494  GABA permease  41.36 
 
 
463 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0284  GABA permease  41.22 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  hitchhiker  0.000157703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2876  GABA permease  41.14 
 
 
463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975083  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0307  GABA permease  41.22 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220085  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5356  gamma-aminobutyrate permease  41.27 
 
 
463 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0302  GABA permease  41.22 
 
 
461 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2780  GABA permease  39.55 
 
 
463 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0786  amino acid tranporter  39.37 
 
 
459 aa  308  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  0.194759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2293  GABA permease  40.94 
 
 
468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114117  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3570  amino acid permease-associated region  45.54 
 
 
460 aa  306  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2872  GABA permease  40.6 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5379  amino acid permease-associated region  39.59 
 
 
459 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0243202  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3459  amino acid permease-associated region  39.82 
 
 
459 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4907  amino acid permease-associated region  39.82 
 
 
459 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492814  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3276  GABA permease  41.78 
 
 
461 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.737428  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2021  amino acid permease-associated region  40.66 
 
 
480 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2523  amino acid permease-associated region  42.99 
 
 
464 aa  299  8e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6223  amino acid permease-associated region  40.4 
 
 
481 aa  299  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4407  amino acid ABC transporter permease  37.7 
 
 
460 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0417319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1447  amino acid permease-associated region  37.7 
 
 
460 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302331  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4114  GABA permease  44.23 
 
 
463 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7767  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10533  gaba permease gabP (4-amino butyrate transport carrier)  41.51 
 
 
434 aa  297  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4926  GABA permease  41.26 
 
 
461 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2188  amino acid permease-associated region  41.63 
 
 
491 aa  296  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000662916  hitchhiker  0.000260404 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2938  gamma-aminobutyrate transporter  38.69 
 
 
466 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.111546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2990  gamma-aminobutyrate transporter  38.69 
 
 
466 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3095  gamma-aminobutyrate transporter  38.69 
 
 
466 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2906  gamma-aminobutyrate transporter  38.69 
 
 
466 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2973  gamma-aminobutyrate transporter  38.69 
 
 
466 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  0.0482196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1998  amino acid permease-associated region  41.69 
 
 
608 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.89102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02519  gamma-aminobutyrate transporter  38.81 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1020  GABA permease  38.81 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02483  hypothetical protein  38.81 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2798  gamma-aminobutyrate transporter  38.81 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2616  amino acid permease-associated region  40.37 
 
 
464 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923502  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3218  gamma-aminobutyrate transporter  38.44 
 
 
466 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3905  gamma-aminobutyrate transporter  38.81 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.667666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2783  gamma-aminobutyrate transporter  38.81 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.414998 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1043  gamma-aminobutyrate transporter  38.81 
 
 
466 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2943  gamma-aminobutyrate transporter  38.57 
 
 
466 aa  289  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4525  amino acid permease-associated region  39.38 
 
 
473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.411369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3973  amino acid permease-associated region  38.15 
 
 
455 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0313  GABA permease  40.54 
 
 
463 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3734  GABA permease  48.37 
 
 
309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9528e-18 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0122  amino acid permease-associated region  41.44 
 
 
606 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3382  amino acid permease-associated region  41.36 
 
 
606 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3371  amino acid permease-associated region  41.36 
 
 
606 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3433  amino acid permease-associated region  41.36 
 
 
606 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0686  beta-alanine/gamma-aminobutyrate-H+ symporter  40.61 
 
 
483 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  39.1 
 
 
471 aa  279  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  38.48 
 
 
461 aa  279  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  38.95 
 
 
468 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>